RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048698.13

Taf6-201, Transcript of Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Taf6, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6-201ENSMUST00000048698 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Talpid3E9PV87 1520 aa21.91■■□□□ 1.1
Taf6-201ENSMUST00000048698 Myom2Q14BI5 1463 aa21.9■■□□□ 1.1
Taf6-201ENSMUST00000048698 Uggt2E9Q4X2 1504 aa21.9■■□□□ 1.1
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Rfx7F8VPJ6 1459 aa21.87■■□□□ 1.09
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Myo5cE9Q1F5 1742 aa21.83■■□□□ 1.08
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Gm13697A2AK42 830 aa21.74■■□□□ 1.07
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Asxl1P59598 1514 aa21.65■■□□□ 1.06
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Bcl9Q9D219 1425 aa21.61■■□□□ 1.05
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa21.58■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cd109Q8R422 1442 aa21.56■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 Scn4aQ9ER60 1841 aa21.56■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 AnkarA2RT91 1465 aa21.55■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 Trak1Q6PD31 939 aa21.55■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.55■■□□□ 1.04
Taf6-201ENSMUST00000048698 Dip2aQ8BWT5 1523 aa21.53■■□□□ 1.04
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Mphosph9A6H5Y1 991 aa21.47■■□□□ 1.03
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Skint5A7XUY5 1461 aa21.46■■□□□ 1.03
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Pip4k2bQ80XI4 416 aa21.45■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ino80Q6ZPV2 1559 aa21.44■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Atp7aQ64430 1491 aa21.43■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Kif13aQ9EQW7 1749 aa21.42■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Iqgap3F8VQ29 1632 aa21.42■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa21.41■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Mier1Q5UAK0 511 aa21.41■■□□□ 1.02
Taf6-201ENSMUST00000048698 Tarbp1E9Q368 1579 aa21.4■■□□□ 1.02
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa21.38■■□□□ 1.01
Taf6-201ENSMUST00000048698 Kif21bQ9QXL1 1668 aa21.38■■□□□ 1.01
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Ncoa1P70365 1447 aa21.38■■□□□ 1.01
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Taf6-201ENSMUST00000048698 ErbinQ80TH2 1402 aa21.31■■□□□ 1
Taf6-201ENSMUST00000048698 Sall3Q62255 1320 aa21.31■■□□□ 1
Taf6-201ENSMUST00000048698 P3h3Q8CG70 732 aa21.29■■□□□ 1
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Abca8aQ8K442 1620 aa21.28■■□□□ 1
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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Taf6-201ENSMUST00000048698 Mroh1E0CZ22 1640 aa21.23■□□□□ 0.99
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