RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000048698.13

Taf6-201, Transcript of Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Taf6, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6-201ENSMUST00000048698 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa32.63■■■□□ 2.81
Taf6-201ENSMUST00000048698 NischQ80TM9 1593 aa32.3■■■□□ 2.76
Taf6-201ENSMUST00000048698 Abcc9P70170 1546 aa31.25■■■□□ 2.59
Taf6-201ENSMUST00000048698 Abcc8B2RUS7 1588 aa31.17■■■□□ 2.58
Taf6-201ENSMUST00000048698 ScribQ80U72 1612 aa30.02■■■□□ 2.4
Taf6-201ENSMUST00000048698 NacadQ5SWP3 1504 aa29.05■■■□□ 2.24
Taf6-201ENSMUST00000048698 Kdm5dQ62240 1548 aa29.05■■■□□ 2.24
Taf6-201ENSMUST00000048698 Dcaf1Q80TR8 1506 aa28.67■■■□□ 2.18
Taf6-201ENSMUST00000048698 Sycp2Q9CUU3 1500 aa28.48■■■□□ 2.15
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa28.17■■■□□ 2.1
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.1■■■□□ 2.09
Taf6-201ENSMUST00000048698 BicraF8VPZ9 1578 aa28.09■■■□□ 2.09
Taf6-201ENSMUST00000048698 Baz1aO88379 1555 aa27.76■■■□□ 2.03
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ccdc180J3QNE4 1664 aa27.73■■■□□ 2.03
Taf6-201ENSMUST00000048698 Crybg2B7ZCC2 1516 aa27.59■■■□□ 2.01
Taf6-201ENSMUST00000048698 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Taf6-201ENSMUST00000048698 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Taf6-201ENSMUST00000048698 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa27.19■■□□□ 1.94
Taf6-201ENSMUST00000048698 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
Taf6-201ENSMUST00000048698 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
Taf6-201ENSMUST00000048698 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.96■■□□□ 1.91
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa26.86■■□□□ 1.89
Taf6-201ENSMUST00000048698 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Taf6-201ENSMUST00000048698 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa26.72■■□□□ 1.87
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ercc6F8VPZ5 1481 aa26.69■■□□□ 1.86
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rtl1Q7M732 1744 aa26.67■■□□□ 1.86
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.59■■□□□ 1.85
Taf6-201ENSMUST00000048698 Wdr62Q3U3T8 1523 aa26.45■■□□□ 1.83
Taf6-201ENSMUST00000048698 Frmpd1A2AKB4 1549 aa26.43■■□□□ 1.82
Taf6-201ENSMUST00000048698 Fam135aQ6NS59 1506 aa26.39■■□□□ 1.81
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa26.3■■□□□ 1.8
Taf6-201ENSMUST00000048698 CftrP26361 1476 aa26.25■■□□□ 1.79
Taf6-201ENSMUST00000048698 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
Taf6-201ENSMUST00000048698 Synj1Q8CHC4 1574 aa26.22■■□□□ 1.79
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa26.22■■□□□ 1.79
Taf6-201ENSMUST00000048698 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
Taf6-201ENSMUST00000048698 Unc13aQ4KUS2 1712 aa26.11■■□□□ 1.77
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ubl4bQ9CQ84 188 aa26.04■■□□□ 1.76
Taf6-201ENSMUST00000048698 Baz1bQ9Z277 1479 aa26.01■■□□□ 1.76
Taf6-201ENSMUST00000048698 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
Taf6-201ENSMUST00000048698 Trim41Q5NCC3 630 aa25.83■■□□□ 1.73
Taf6-201ENSMUST00000048698 Mrc2Q64449 1479 aa25.8■■□□□ 1.72
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
Taf6-201ENSMUST00000048698 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.55■■□□□ 1.68
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cux2P70298 1426 aa25.49■■□□□ 1.67
Taf6-201ENSMUST00000048698 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
Taf6-201ENSMUST00000048698 Golga3P55937 1487 aa25.34■■□□□ 1.65
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.3■■□□□ 1.64
Taf6-201ENSMUST00000048698 Top2bQ64511 1612 aa25.3■■□□□ 1.64
Taf6-201ENSMUST00000048698 Kif21aQ9QXL2 1672 aa25.28■■□□□ 1.64
Taf6-201ENSMUST00000048698 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Taf6-201ENSMUST00000048698 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa25.25■■□□□ 1.63
Taf6-201ENSMUST00000048698 TnnQ80Z71 1560 aa25.19■■□□□ 1.62
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cep164Q5DU05 1446 aa25.14■■□□□ 1.62
Taf6-201ENSMUST00000048698 Il27Q8K3I6 234 aa25.1■■□□□ 1.61
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.09■■□□□ 1.61
Taf6-201ENSMUST00000048698 Fmn1Q05860 1466 aa25.02■■□□□ 1.6
Taf6-201ENSMUST00000048698 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.02■■□□□ 1.6
Taf6-201ENSMUST00000048698 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Taf6-201ENSMUST00000048698 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Taf6-201ENSMUST00000048698 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Taf6-201ENSMUST00000048698 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Taf6-201ENSMUST00000048698 Plb1Q3TTY0 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
Taf6-201ENSMUST00000048698 Crocc2F6XLV1 1638 aa24.85■■□□□ 1.57
Taf6-201ENSMUST00000048698 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa24.73■■□□□ 1.55
Taf6-201ENSMUST00000048698 Duox2A2AQ99 1517 aa24.7■■□□□ 1.54
Taf6-201ENSMUST00000048698 Grin2bQ01097 1482 aa24.69■■□□□ 1.54
Taf6-201ENSMUST00000048698 Ift140E9PY46 1464 aa24.62■■□□□ 1.53
Taf6-201ENSMUST00000048698 Chic1Q8CBW7 227 aa24.59■■□□□ 1.53
Taf6-201ENSMUST00000048698 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Taf6-201ENSMUST00000048698 Samd9lQ69Z37 1561 aa24.52■■□□□ 1.52
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rusc2Q80U22 1514 aa24.52■■□□□ 1.52
Taf6-201ENSMUST00000048698 Efcab5A0JP43 1406 aa24.51■■□□□ 1.51
Taf6-201ENSMUST00000048698 Disp1Q3TDN0 1521 aa24.48■■□□□ 1.51
Taf6-201ENSMUST00000048698 Shroom2A2ALU4 1481 aa24.46■■□□□ 1.51
Taf6-201ENSMUST00000048698 NrkQ9R0G8 1455 aa24.43■■□□□ 1.5
Taf6-201ENSMUST00000048698 Dnajc5P60904 198 aa24.43■■□□□ 1.5
Taf6-201ENSMUST00000048698 Setd1bQ8CFT2 1985 aa24.42■■□□□ 1.5
Taf6-201ENSMUST00000048698 Rad54l2Q99NG0 1466 aa24.36■■□□□ 1.49
Taf6-201ENSMUST00000048698 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Taf6-201ENSMUST00000048698 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
Taf6-201ENSMUST00000048698 PtprkP35822 1457 aa24.35■■□□□ 1.49
Taf6-201ENSMUST00000048698 Shroom4Q1W617 1475 aa24.34■■□□□ 1.49
Taf6-201ENSMUST00000048698 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa24.31■■□□□ 1.48
Taf6-201ENSMUST00000048698 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
Taf6-201ENSMUST00000048698 Grin2aP35436 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
Taf6-201ENSMUST00000048698 Magi3Q9EQJ9 1476 aa24.27■■□□□ 1.48
Taf6-201ENSMUST00000048698 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Taf6-201ENSMUST00000048698 SynmQ70IV5 1561 aa24.18■■□□□ 1.46
Taf6-201ENSMUST00000048698 Zeb1Q64318 1117 aa24.17■■□□□ 1.46
Taf6-201ENSMUST00000048698 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Taf6-201ENSMUST00000048698 Pla2r1Q62028 1487 aa24.14■■□□□ 1.45
Taf6-201ENSMUST00000048698 HrcG5E8J6 738 aa24.12■■□□□ 1.45
Taf6-201ENSMUST00000048698 Npm2Q80W85 207 aa24.12■■□□□ 1.45
Taf6-201ENSMUST00000048698 Col17a1Q07563 1470 aa24.11■■□□□ 1.45
Taf6-201ENSMUST00000048698 Gpatch8A2A6A1 1505 aa24.05■■□□□ 1.44
Taf6-201ENSMUST00000048698 Fgd6Q69ZL1 1399 aa24.04■■□□□ 1.44
Taf6-201ENSMUST00000048698 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa24.03■■□□□ 1.44
Taf6-201ENSMUST00000048698 Gab3Q8BSM5 595 aa24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11.2 ms