RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28,72■■■□□ 2,19
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kidins220E9Q9B7 1793 aa28,68■■■□□ 2,18
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa28,21■■■□□ 2,11
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Qser1A2BIE1 1698 aa28,2■■■□□ 2,1
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tarbp1E9Q368 1579 aa28,18■■■□□ 2,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28,18■■■□□ 2,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Synj2Q9D2G5 1434 aa28,17■■■□□ 2,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif3bQ61771 747 aa28,17■■■□□ 2,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Atp10aO54827 1508 aa28,16■■■□□ 2,1
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plch2A2AP18 1501 aa28,15■■■□□ 2,1
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Supt16hQ920B9 1047 aa28,15■■■□□ 2,1
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP28,13■■■□□ 2,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Plekhg5Q66T02 1073 aa28,12■■■□□ 2,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Polr3aB2RXC6 1390 aa28,11■■■□□ 2,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP28,11■■■□□ 2,09
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28,11■■■□□ 2,09
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP28,1■■■□□ 2,09
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa28,07■■■□□ 2,08
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Card11Q8CIS0 1159 aa28,05■■■□□ 2,08
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Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Bcl11aQ9QYE3 773 aa28■■■□□ 2,07
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