RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029047.11

Snx16-201, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-201ENSMUST00000029047 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Fancd2Q80V62 1450 aa22.38■■□□□ 1.17
Snx16-201ENSMUST00000029047 Rusc2Q80U22 1514 aa22.36■■□□□ 1.17
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Pank3Q8R2W9 370 aa22.11■■□□□ 1.13
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Tex14Q7M6U3 1450 aa22.07■■□□□ 1.12
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Zscan10Q3URR7 782 aa22.05■■□□□ 1.12
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Prdm16A2A935 1275 aa22.03■■□□□ 1.12
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Snx16-201ENSMUST00000029047 ShprhQ7TPQ3 1674 aa21.99■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.98■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Abca8bQ8K440 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Pola1P33609 1465 aa21.96■■□□□ 1.11
Snx16-201ENSMUST00000029047 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa21.95■■□□□ 1.1
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Chd1P40201 1711 aa21.93■■□□□ 1.1
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