RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa34.71■■■■□ 3.15
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa34.65■■■■□ 3.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ssh2Q5SW75 1423 aa34.64■■■■□ 3.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naip5Q9R016 1403 aa34.64■■■■□ 3.14
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dip2bQ3UH60 1574 aa34.64■■■■□ 3.14
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Knl1Q66JQ7 1612 aa34.59■■■■□ 3.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 UacaQ8CGB3 1411 aa34.59■■■■□ 3.13
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa34.59■■■■□ 3.13
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps8Q0P5W1 1427 aa34.53■■■■□ 3.12
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bcl9Q9D219 1425 aa34.5■■■■□ 3.11
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rfx7F8VPJ6 1459 aa34.49■■■■□ 3.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa34.48■■■■□ 3.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm13697A2AK42 830 aa34.48■■■■□ 3.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ShprhQ7TPQ3 1674 aa34.47■■■■□ 3.11
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myo5cE9Q1F5 1742 aa34.45■■■■□ 3.11
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde4cQ3UEI1 686 aa34.42■■■■□ 3.1
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hfm1D3Z4R1 1434 aa34.37■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prex1Q69ZK0 1650 aa34.36■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dip2aQ8BWT5 1523 aa34.35■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clstn2Q9ER65 966 aa34.35■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adamts7Q68SA9 1657 aa34.35■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abcc6Q9R1S7 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scn4aQ9ER60 1841 aa34.32■■■■□ 3.09
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AlkP97793 1621 aa34.26■■■■□ 3.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map4P27546 1125 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Robo2Q7TPD3 1470 aa34.22■■■■□ 3.07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp644E9QA22 1323 aa34.19■■■■□ 3.06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ube2uB1AUC4 352 aa34.16■■■■□ 3.06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttc21bQ0HA38 1315 aa34.15■■■■□ 3.06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fhad1A6PWD2 1420 aa34.14■■■■□ 3.06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Akap12Q9WTQ5 1684 aa34.13■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pip4k2bQ80XI4 416 aa34.13■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncoa1P70365 1447 aa34.12■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa34.11■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa34.1■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa34.09■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nsd2Q8BVE8 1365 aa34.09■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Asxl1P59598 1514 aa34.09■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 AnkarA2RT91 1465 aa34.08■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myom3A2ABU4 1439 aa34.08■■■■□ 3.05
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa34.04■■■■□ 3.04
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa34.03■■■■□ 3.04
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ttll5Q8CHB8 1328 aa34.03■■■■□ 3.04
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa34■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd109Q8R422 1442 aa33.99■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Skint5A7XUY5 1461 aa33.95■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rims2Q9EQZ7 1530 aa33.95■■■■□ 3.03
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprgQ05909 1442 aa33.94■■■■□ 3.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ino80Q6ZPV2 1559 aa33.93■■■■□ 3.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trak1Q6PD31 939 aa33.9■■■■□ 3.02
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Erich6D3Z6S9 713 aa33.87■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif13aQ9EQW7 1749 aa33.86■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tarbp1E9Q368 1579 aa33.85■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efcab6Q6P1E8 1516 aa33.84■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tecpr2Q3UH45 1423 aa33.84■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa33.84■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iqgap3F8VQ29 1632 aa33.82■■■■□ 3.01
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo41Q6NS60 873 aa33.82■■■■□ 3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rapgef3Q8VCC8 918 aa33.81■■■■□ 3
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Naip7Q9JIB3 1402 aa33.78■■■■□ 3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Uggt1Q6P5E4 1551 aa33.77■■■■□ 3
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp7aQ64430 1491 aa33.77■■■■□ 3
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk24Q99KH8 431 aa33.73■■■□□ 2.99
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ErbinQ80TH2 1402 aa33.67■■■□□ 2.98
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P3h3Q8CG70 732 aa33.65■■■□□ 2.98
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PzpQ61838 1495 aa33.64■■■□□ 2.98
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Psme1P97371 249 aa33.64■■■□□ 2.98
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa33.62■■■□□ 2.97
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