RNA–Protein interactions for RNA: YOR345C

YOR345C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YOR345C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR345C	YOR345C	YDL211C	Q12121	372 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ATP16	Q12165	160 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	UBA3	Q99344	299 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CTA1	P15202	515 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.49	□□□□□ -2.33	not detected
YOR345C	YOR345C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	COX10	P21592	462 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ADK2	P26364	225 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	INO2	P26798	304 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	PUP2	P32379	260 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	TIP20	P33891	701 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	LTV1	P34078	463 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	QDR3	P38227	689 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MED8	P38304	223 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	SMF2	P38778	549 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.49	□□□□□ -2.33	not detected
YOR345C	YOR345C	YJR054W	P47114	497 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ROG1	P53118	685 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CDH1	P53197	566 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YPL080C	Q02826	108 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YOR376W	Q08900	122 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MMT2	Q08970	484 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	FLO11	P08640	1367 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	COX3	P00420	269 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	OPI3	P05375	206 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MET2	P08465	486 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	PDX1	P16451	410 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RRT12	P25381	491 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YSC83	P32792	385 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	TAE1	P38340	232 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YMR262W	P38430	313 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	FAD1	P38913	306 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ZIM17	P42844	174 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YFR018C	P43599	363 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ECO1	P43605	281 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YGL118C	P53132	145 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RSM27	P53305	110 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RRN9	P53437	365 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	AQR1	P53943	586 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	VPS9	P54787	451 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CIK1	Q01649	594 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RMT2	Q03305	412 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YLR456W	Q06199	204 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	NDL1	Q06568	189 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RNH203	Q12338	110 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	IES3	Q12345	250 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MRX4	Q12467	430 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ERV1	P27882	189 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MSK1	P32048	576 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	PXA2	P34230	853 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CAB3	P36076	571 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	IST2	P38250	946 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RCK1	P38622	512 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CTM1	P38818	585 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	MNL1	P38888	796 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	SNL1	P40548	159 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	EFM3	P47163	339 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	PMT5	P52867	743 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YGR016W	P53209	190 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	CAX4	P53223	239 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	HCH1	P53834	153 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YLH47	Q06493	454 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	IPK1	Q06667	281 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	YOL075C	Q08234	1294 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	ALE1	Q08548	619 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	GLE1	Q12315	538 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YOR345C	YOR345C	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	DAL81	P21657	970 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	YKL187C	P34231	750 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	HEM14	P40012	539 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	INP1	Q03694	420 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YOR345C	YOR345C	TRM82	Q03774	444 aa		0.46	□□□□□ -2.34

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