RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	HAT2	P39984	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BUR6	P40096	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GAT2	P40209	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YJL068C	P40363	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YIL089W	P40500	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TRM9	P49957	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CLD1	P53264	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	AAT1	Q01802	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ROY1	Q04847	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CRT10	Q08226	957 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	AAD15	Q08361	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRL2	Q12020	392 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RKM5	Q12367	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	UBR1	P19812	1950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GCR1	P07261	785 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUC1	P08466	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GAL2	P13181	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SDH2	P21801	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YCL002C	P25565	263 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PRE4	P30657	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SFP1	P32432	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MMS21	P38632	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PPE1	P38796	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
EXO1	YOR033C	YER121W	P40076	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	COG3	P40094	801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ELO3	P40319	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YIL067C	P40514	678 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YIL024C	P40543	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	HXT8	P40886	569 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ALY2	P47029	1046 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TAX4	P47030	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ALT2	P52892	507 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RTA1	P53047	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGL185C	P53100	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGR126W	P53274	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BIO4	P53630	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	STD1	Q02794	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	EKI1	Q03764	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ATG39	Q06159	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GAL7	P08431	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DDI2	P0CH63	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SNF6	P18888	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	KIN82	P25341	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ZRT3	P34240	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRY1	P36007	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	DOA1	P36037	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	EHT1	P38295	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ARN1	P38731	627 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	GPI16	P38875	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PHO90	P39535	881 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VPS52	P39904	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGL159W	P53110	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PEX31	P53203	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	ADI1	Q03677	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CSM3	Q04659	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUT2	Q06213	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	RMD5	Q12508	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRF1	Q12516	437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	CAN1	P04817	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	MSF1	P08425	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YCL049C	P25577	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SNC1	P31109	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	IXR1	P33417	597 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SRB2	P34162	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YBR197C	P38306	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	VRG4	P40107	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	FMC1	P40491	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	PMT6	P42934	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	QRI7	P43122	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NIT2	P47016	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YJR012C	P47087	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	NUP57	P48837	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGR066C	P53242	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EXO1	YOR033C	YGR079W	P53249	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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