RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MAS1	P10507	462 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TFS1	P14306	219 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PPH22	P23595	377 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	URK1	P27515	501 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SEC17	P32602	292 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PPQ1	P32945	549 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SGE1	P33335	543 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SDH3	P33421	198 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MBA1	P38300	278 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	RPH1	P39956	796 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	BUR6	P40096	142 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	STE24	P47154	453 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	DIE2	P50076	525 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	COQ6	P53318	479 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	VAC7	P53950	1165 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TIM44	Q01852	431 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MET31	Q03081	177 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	STP3	Q05937	343 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YLR446W	Q06204	433 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	CRT10	Q08226	957 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	BUD7	Q08754	746 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	NDJ1	Q12366	352 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YPR1	Q12458	312 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YOR338W	Q99326	363 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	HIP1	P06775	603 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	STE4	P18851	423 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	ARO7	P32178	256 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MRP20	P32387	263 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SIP1	P32578	815 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	ZRT3	P34240	503 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YKL063C	P35725	167 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	UIP5	P36137	443 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SER3	P40054	469 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	RRG9	P40156	214 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YKE4	P40544	346 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PMT4	P46971	762 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	BIO3	P50277	480 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MRH4	P53166	561 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MRPL50	P53724	139 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SWT1	Q12104	458 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SIA1	Q12212	622 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PST1	Q12355	444 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	PDE2	P06776	526 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MNE1	P24720	663 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MIT1	P40002	666 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SSU1	P41930	458 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	HMS2	P47175	358 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MDM34	P53083	459 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TPN1	P53099	579 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	MKC7	P53379	596 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YNL260C	P53846	198 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YNL140C	P53910	189 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YAT1	P80235	687 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YPL071C	Q02864	156 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	TRM82	Q03774	444 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YPR114W	Q06107	315 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SPO77	Q06134	477 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	NMD4	Q12129	218 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	YLR046C	Q12253	270 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	SFM1	Q12314	213 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	RTN2	Q12443	393 aa		5.28	□□□□□ -1.56
PSH1	YOL054W	NUM1	Q00402	2748 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	AAC1	P04710	309 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SEN2	P16658	377 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ERG8	P24521	451 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	PGS1	P25578	521 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GEX1	P25596	615 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	ADK2	P26364	225 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
PSH1	YOL054W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
PSH1	YOL054W	OAC1	P32332	324 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	SPO23	P33757	523 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	GEX2	P36173	615 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	UBS1	P38290	277 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PSH1	YOL054W	DBP8	P38719	431 aa		5.27	□□□□□ -1.57

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