RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	STE3	P06783	470 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	FAR1	P21268	830 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	CDH1	P53197	566 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	ARR1	Q06596	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	APC5	Q08683	685 aa		3.35	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	SAG1	P20840	650 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	PMT2	P31382	759 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	STB1	P42845	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YHC3	P47040	408 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	BIO3	P50277	480 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YGR015C	P53208	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	NAT4	Q04751	285 aa		3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
KAR5	YMR065W	EPT1	P22140	391 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.88	not detected
KAR5	YMR065W	ATG7	P38862	630 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YER184C	P39961	794 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YNL320W	P42840	284 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YJR054W	P47114	497 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PRM1	P53835	661 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RMI1	Q02685	241 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	TRM82	Q03774	444 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YOR376W	Q08900	122 aa		3.34	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PUT4	P15380	627 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MXR2	P25566	168 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SIF2	P38262	535 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	ECM34	P38728	170 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	CHL4	P38907	458 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MOB2	P43563	287 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	EFM3	P47163	339 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MRX11	Q03079	207 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	FRE8	Q12209	686 aa		3.33	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SSK2	P53599	1579 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MKK1	P32490	508 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MRPS5	P33759	307 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	IST2	P38250	946 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YIL089W	P40500	205 aa		3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SPT7	P35177	1332 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	BNI1	P41832	1953 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	HXT2	P23585	541 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SMP1	P38128	452 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SHE1	P38200	338 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RCK2	P38623	610 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YHR122W	P38829	231 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SLM3	Q12093	417 aa		3.31	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	URA10	P30402	227 aa		3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SUR7	P54003	302 aa		3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PIN3	Q06449	215 aa		3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	IES4	Q08561	116 aa		3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RAX2	Q12465	1220 aa		3.3	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	UTR1	P21373	530 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PCH2	P38126	564 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YMR134W	P40207	237 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	CSM3	Q04659	317 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	STE2	D6VTK4	431 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	SMI1	P32566	505 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	IML3	P38265	245 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	ALP1	P38971	573 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	HST1	P53685	503 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YNL146W	P53906	100 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RGS2	Q99188	309 aa		3.29	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	CIN8	P27895	1000 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YKL071W	P36086	256 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RRT13	P40042	185 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	YGR067C	P53243	804 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	ALE1	Q08548	619 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	PSY3	Q12318	242 aa		3.28	□□□□□ -1.88
KAR5	YMR065W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	CDC25	P04821	1589 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	RAD1	P06777	1100 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	ZIP1	P31111	875 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YEL043W	P32618	956 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	DTR1	P38125	572 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	COQ5	P49017	307 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YGL114W	P53134	725 aa		3.27	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	ERG9	P29704	444 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	MYO3	P36006	1272 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	GGC1	P38988	300 aa		3.26	□□□□□ -1.89

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