RNA–Protein interactions for RNA: YLR250W

SSP120, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SSP120, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP120	YLR250W	RSC58	Q07979	502 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	HNT3	Q08702	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	GRE1	Q08969	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	PRB1	P09232	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YPK2	P18961	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	DBF20	P32328	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	SPC29	P33419	253 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YBR220C	P38318	560 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	MOB2	P43563	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	MMT1	Q03218	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	SCS7	Q03529	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	HSP31	Q04432	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	DYN3	Q04949	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	CRT10	Q08226	957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	NSL1	Q12143	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	RNH203	Q12338	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP120	YLR250W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YCR100C	P25606	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ITR2	P30606	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TIM12	P32830	109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SKN7	P38889	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	KRE29	P40026	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YGR201C	P42936	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	IRC7	P43623	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TRS85	P46944	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	BRR6	P53062	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MEP3	P53390	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ASI1	P54074	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ACS1	Q01574	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	IRC19	Q07843	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RLM1	Q12224	676 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GEP5	Q12393	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	UGA1	P17649	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CSM1	P25651	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	HIR2	P32480	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TRM5	P38793	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	COG3	P40094	801 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	NAS2	P40555	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SNM1	P40993	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MNT4	P53745	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SKO1	Q02100	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SSY1	Q03770	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YAP6	Q03935	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RSM24	Q03976	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	ARO10	Q06408	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	NTG2	Q08214	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	HMS1	Q12398	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	TIM9	O74700	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RHB1	P25378	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RER1	P25560	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	DEP1	P31385	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	MCM10	P32354	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PPG1	P32838	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	PEX6	P33760	1030 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	CHK1	P38147	527 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP120	YLR250W	RPP1	P38786	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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