RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	RDS1	P25611	832 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	HMX1	P32339	317 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	DTR1	P38125	572 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SHE1	P38200	338 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	ATG7	P38862	630 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	RRT13	P40042	185 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YNL320W	P42840	284 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	MOB2	P43563	287 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	ARR1	Q06596	294 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	APC5	Q08683	685 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SFG1	Q12507	346 aa		3.51	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	GRR1	P24814	1151 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	FMT1	P32785	401 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	COQ5	P49017	307 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YGR067C	P53243	804 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	NAT4	Q04751	285 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	NFI1	Q12216	726 aa		3.5	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	STE3	P06783	470 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	ZIP1	P31111	875 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	RCK2	P38623	610 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YNL143C	P53908	130 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SLM3	Q12093	417 aa		3.49	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	MXR2	P25566	168 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	URA10	P30402	227 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	MRPS5	P33759	307 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	FHL1	P39521	936 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YHC3	P47040	408 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	HST1	P53685	503 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	AQR1	P53943	586 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	DDC1	Q08949	612 aa		3.48	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SAG1	P20840	650 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	MKK1	P32490	508 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	PCH2	P38126	564 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	IST2	P38250	946 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	EFM3	P47163	339 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	SUR7	P54003	302 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	PRM7	Q12459	698 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.47	□□□□□ -1.85
OMA1	YKR087C	YKL071W	P36086	256 aa		3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	GGC1	P38988	300 aa		3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	API2	Q04413	109 aa		3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.46	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	HXT2	P23585	541 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	IML3	P38265	245 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	PRM1	P53835	661 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	CSM3	Q04659	317 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	MMT2	Q08970	484 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	FLO11	P08640	1367 aa		3.45	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	UTR1	P21373	530 aa		3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	NRM1	P53718	249 aa		3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	MRX8	Q05473	314 aa		3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	ALE1	Q08548	619 aa		3.44	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.43	□□□□□ -1.86	not detected
OMA1	YKR087C	SWI3	P32591	825 aa		3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	BLI1	P35727	113 aa		3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	APE4	P38821	490 aa		3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	HIT1	P46973	164 aa		3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	SED5	Q01590	340 aa		3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	RAD1	P06777	1100 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	CIN8	P27895	1000 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	SIF2	P38262	535 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YHR122W	P38829	231 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	ALP1	P38971	573 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YCH1	P42937	148 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YFR018C	P43599	363 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	SCS7	Q03529	384 aa		3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	MYO3	P36006	1272 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	TAE1	P38340	232 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	FRT2	P39734	528 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YIL089W	P40500	205 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	YIR035C	P40579	254 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	HST4	P53688	370 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	TAF10	Q12030	206 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	RPN6	Q12377	434 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	RGS2	Q99188	309 aa		3.41	□□□□□ -1.86
OMA1	YKR087C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
OMA1	YKR087C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
OMA1	YKR087C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
OMA1	YKR087C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
OMA1	YKR087C	YMR134W	P40207	237 aa		3.4	□□□□□ -1.87
OMA1	YKR087C	YNL146W	P53906	100 aa		3.4	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms