RNA–Protein interactions for RNA: YKR071C

DRE2, Transcript of Component of the cytosolic Fe-S protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene DRE2, Length 1,047 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRE2	YKR071C	YCR051W	P25631	222 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YPR196W	Q06595	470 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	NPC2	Q12408	173 aa		5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	KSS1	P14681	368 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	CTR86	P25355	563 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	SMK1	P41808	388 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YFL051C	P43552	160 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	TOM22	P49334	152 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	MRM2	P53123	320 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	MAL12	P53341	584 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	EKI1	Q03764	534 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	SNX41	Q04053	625 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YKU80	Q04437	629 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RAF1	Q06891	181 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	NCA2	Q12374	616 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RPN6	Q12377	434 aa		5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	DYN1	P36022	4092 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	PMR1	P13586	950 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YCL049C	P25577	312 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	MRPL39	P36533	70 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	ECM34	P38728	170 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	ARN1	P38731	627 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YHL037C	P38733	133 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.78	□□□□□ -1.48	not detected
DRE2	YKR071C	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	GAB1	P41733	394 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	COS6	P53344	381 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	YDR476C	Q03362	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RSN1	Q03516	953 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	RAD30	Q04049	632 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	API2	Q04413	109 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	COX20	Q04935	205 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	ARR1	Q06596	294 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
DRE2	YKR071C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	UTR1	P21373	530 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	SAN1	P22470	610 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	FRE2	P36033	711 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	MRPL17	P36528	281 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	SIT1	P39980	628 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	AVT7	P40501	490 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	CHA4	P43634	648 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	NIT2	P47016	307 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YPL039W	Q03080	316 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RIM13	Q03792	727 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YLR413W	Q06689	675 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	ENB1	Q08299	606 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	DCI1	Q08558	271 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	PSY3	Q12318	242 aa		5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RAP1	P11938	827 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	NPP1	P25353	742 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	EHD3	P28817	500 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YKL187C	P34231	750 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YHR180W	P38868	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	FET3	P38993	636 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	TDA10	P42938	290 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	IMA1	P53051	589 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	URC2	Q04411	772 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	COQ11	Q05892	277 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	ARV1	Q06541	321 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YOL131W	Q08270	108 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YDL180W	Q12301	547 aa		5.76	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	PUT2	P07275	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	TFS1	P14306	219 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	MER1	P16523	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	PHO81	P17442	1178 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	MRPS5	P33759	307 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	MTC6	P38849	526 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	IDP2	P41939	412 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	TOS2	P50078	622 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YML119W	Q03208	357 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	HNT3	Q08702	217 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	YOR214C	Q12282	236 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	BLM10	P43583	2143 aa		5.74	□□□□□ -1.49
DRE2	YKR071C	ARG3	P05150	338 aa		5.74	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.6 ms