RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRB10	Q13322	594 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DRP2	Q13474	957 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRP4	Q96MN2	994 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RGS18	Q9NS28	235 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SI	P14410	1827 aa		18.51	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WZ62	844 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPOP	A6NHQ4	379 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DGKI	O75912	1065 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LYPLA2	O95372	231 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPRED2	Q7Z698	418 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF410	Q86VK4	478 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM192	Q8IY95	271 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTR	Q99707	1265 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB34	Q9BZG1	259 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		18.5	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB39	O15060	712 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASAP2	O43150	1006 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	MGEA5	O60502	916 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	18.49	■□□□□ 0.55	9e-8	■■□□□ 13
JMJD1C-211	ENST00000633035	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	18.49	■□□□□ 0.55	2e-6	■■■□□ 17.4
JMJD1C-211	ENST00000633035	EMC2	Q15006	297 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	EPC2	Q52LR7	807 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM143	Q96AN5	459 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO9B	Q13459	2157 aa		18.49	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DGAT1	O75907	488 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTGDR	Q13258	359 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBR1	Q14596	966 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRO	Q16827	1216 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	KSR1	Q8IVT5	923 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	NACC1	Q96RE7	527 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DACT1	Q9NYF0	836 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK24	Q9Y6E0	443 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		18.48	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035		C9IYK1	514 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAD1	O00515	517 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RB1	P06400	928 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	FGFR4	P22455	802 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTNNB1	P35222	781 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPM6B	Q13491	265 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHST12	Q9NRB3	414 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		18.47	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXA2	O43364	376 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDC	P20941	246 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPA1	P27694	616 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMPR1A	P36894	532 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	RARRES1	P49788	294 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TFDP1	Q14186	410 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDIA5	Q14554	519 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DSC3	Q14574	896 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABI1	Q8IZP0	508 aa		18.46	■□□□□ 0.55
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC3	P53804	2025 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A087WWV3	80 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035		H3BNC9	293 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	LPXN	O60711	386 aa		18.45	■□□□□ 0.54
JMJD1C-211	ENST00000633035	MED24	O75448	989 aa		18.45	■□□□□ 0.54

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