RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
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SENP3-209ENST00000610454 COL4A6Q14031 1691 aa14.95□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.93□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 STK24Q9Y6E0 443 aa14.93□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 DGAT1O75907 488 aa14.92□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.92□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.92□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 ZBTB39O15060 712 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 HOXA2O43364 376 aa14.91□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 FGFR4P22455 802 aa14.91□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 RARRES1P49788 294 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 CUL4AQ13619 759 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 TFDP1Q14186 410 aa14.91□□□□□ -0.02
SENP3-209ENST00000610454 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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SENP3-209ENST00000610454 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.91□□□□□ -0.02
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