RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582578.2

GTSCR1-201, Transcript of Gilles de la Tourette syndrome chromosome region, candidate 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTSCR1, Length 470 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSCR1-201ENST00000582578 SNHG28P0DPA3 235 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 HSD17B4P51659 736 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 NEDD9Q14511 834 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 GNPTABQ3T906 1256 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 PRR23CQ6ZRP0 262 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 LRRC43Q8N309 656 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RGS18Q9NS28 235 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SQORQ9Y6N5 450 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TTC3P53804 2025 aa6.7□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ZZEF1O43149 2961 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 C9IYK1 514 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TK2O00142 265 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ORC4O43929 436 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RPS6KA5O75582 802 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SEMA3FQ13275 785 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ABI1Q8IZP0 508 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 VPS52Q8N1B4 723 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RNF169Q8NCN4 708 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SHDQ96IW2 340 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MYADMQ96S97 322 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ZBP1Q9H171 429 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 EPS15L1Q9UBC2 864 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 CLUHO75153 1309 aa6.69□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 COL4A3Q01955 1670 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 FAM170BA6NMN3 283 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TAF4O00268 1085 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 FIBPO43427 364 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RETP07949 1114 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RLBP1P12271 317 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SPINK2P20155 84 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 STARD6P59095 220 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 KRT76Q01546 638 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 CSRP2Q16527 193 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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GTSCR1-201ENST00000582578 NELL1Q92832 810 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 TMEM169Q96HH4 297 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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GTSCR1-201ENST00000582578 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MYL10Q9BUA6 226 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RNF19AQ9NV58 838 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.68□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 MAST4O15021 2626 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 IGF2RP11717 2491 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 FOXP2O15409 715 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 HOXA2O43364 376 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 LRP3O75074 770 aa6.67□□□□□ -1.34
GTSCR1-201ENST00000582578 RAB11FIP3O75154 756 aa6.67□□□□□ -1.34
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