RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 SBF2Q86WG5 1849 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 NHSQ6T4R5 1651 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRM-208ENST00000578600 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQ27 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQ64 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQC6 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PQD8 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SLC12A8A0AV02 714 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SHTN1A0MZ66 631 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PRC1O43663 620 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO21O94952 628 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PDE6AP16499 860 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PRKCAP17252 672 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SESN3P58005 492 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PLCL1Q15111 1095 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GPR19Q15760 415 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 OSTM1Q86WC4 334 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CHPFQ8IZ52 775 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NUP43Q8NFH3 380 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HOOK2Q96ED9 719 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 BOCQ9BWV1 1114 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 OXSMQ9NWU1 459 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PAPPAQ13219 1627 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NSD2O96028 1365 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GABRDO14764 452 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 AKAP10O43572 662 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SCGB1D2O95969 90 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GLI4P10075 376 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 COL6A2P12110 1019 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CCND1P24385 295 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 AMPHP49418 695 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 JAM2P57087 298 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TMF1P82094 1093 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF174Q15697 407 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LILRA2Q8N149 483 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 EFHBQ8N7U6 833 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 USP33Q8TEY7 942 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SLC5A5Q92911 643 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 RELTQ969Z4 430 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 COG3Q96JB2 828 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 AKAP12Q02952 1782 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 DGKIO75912 1065 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NTRK1P04629 796 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MYBL2P10244 700 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TACR1P25103 407 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CYP4F8P98187 520 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SNX17Q15036 470 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC41Q15345 812 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PTPN21Q16825 1174 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 EMC4Q5J8M3 183 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 HIP1RO75146 1068 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 TADA3O75528 432 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 MMP10P09238 476 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 PNLIPP16233 465 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 SLC6A11P48066 632 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRM-208ENST00000578600 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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