RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-215	ENST00000563295	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CEP170P1	Q96L14	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295		C9IYK1	514 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	WNT7A	O00755	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MGEA5	O60502	916 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SLITRK3	O94933	977 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RFC5	P40937	340 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NPEPPS	P55786	919 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM189B	P81408	668 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CYP4A11	Q02928	519 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DRP2	Q13474	957 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GPM6B	Q13491	265 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DSC3	Q14574	896 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NEK9	Q8TD19	979 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	LYPLA2	O95372	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CTNNB1	P35222	781 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF174	Q15697	407 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	XKR9	Q5GH70	373 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PLVAP	Q9BX97	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	COG5	Q9UP83	839 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MYO7A	Q13402	2215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295		A0A087WZ62	844 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ZBTB39	O15060	712 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	HOXA2	O43364	376 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	EMC2	Q15006	297 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TTC38	Q5R3I4	469 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	HLA-C	Q95604	372 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	POTEM	A6NI47	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	ASAP2	O43150	1006 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	EOMES	O95936	686 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.09	□□□□□ -0.63
KIFC3-215	ENST00000563295	FGFR4	P22455	802 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms