RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547310.1

LGR5-204, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 5, human

TSL 3

Gene LGR5, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR5-204	ENST00000547310	CD83	Q01151	205 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	SLC6A3	Q01959	620 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	CDSN	Q15517	529 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	6.29	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310		A0A0G2JNJ9	132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	CSF2RB	P32927	897 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	MAP3K12	Q12852	859 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	STRN3	Q13033	797 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	KLF10	Q13118	480 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	MOGS	Q13724	837 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	LGI4	Q8N135	537 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	UBR7	Q8N806	425 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	SLC5A5	Q92911	643 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310		Q9UFV3	132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
LGR5-204	ENST00000547310	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	B4GALT3	O60512	393 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ULK1	O75385	1050 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RGS3	P49796	1198 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	BCAR1	P56945	870 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	SESN3	P58005	492 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	MYBPC3	Q14896	1274 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	SURF1	Q15526	300 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RASSF3	Q86WH2	238 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	VWA7	Q9Y334	891 aa		6.27	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	MAFG	O15525	162 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	TGFB2	P61812	414 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	FAP	Q12884	760 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	DDB1	Q16531	1140 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	BROX	Q5VW32	411 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		6.26	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ADCY2	Q08462	1091 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	STAT4	Q14765	748 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	INVS	Q9Y283	1065 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		6.25	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310		A0A0A6YYJ9	748 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	GPR39	O43194	453 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	AMH	P03971	560 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	HMGCR	P04035	888 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	CNGA1	P29973	690 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ID4	P47928	161 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	EPHB4	P54760	987 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	INHBE	P58166	350 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	NFYC	Q13952	458 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	MYL10	Q9BUA6	226 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	POFUT1	Q9H488	388 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	MSL2	Q9HCI7	577 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		6.24	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310		K7ESF4	209 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	ADCY8	P40145	1251 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PPP2CB	P62714	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	PPP2CA	P67775	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	DGKD	Q16760	1214 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.23	□□□□□ -1.41
LGR5-204	ENST00000547310	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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