RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	UGCG	Q16739	394 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RUFY3	Q7L099	469 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GJA10	Q969M2	543 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CASD1	Q96PB1	797 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		18.11	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	NEFL	P07196	543 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	GPC3	P51654	580 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	SCLT1	Q96NL6	688 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RNF19A	Q9NV58	838 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		18.1	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CPLX1	O14810	134 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	FSCN2	O14926	492 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PSMD10	O75832	226 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	PLCB3	Q01970	1234 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	DUSP6	Q16828	381 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777		Q4G0T1	1027 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	ABI1	Q8IZP0	508 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	RDM1	Q8NG50	284 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	LZTS1	Q9Y250	596 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		18.09	■□□□□ 0.49
DDX11-222	ENST00000542777	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FSD2	A1L4K1	749 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DEXI	O95424	95 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	FGFR4	P22455	802 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CYP3A7	P24462	503 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	BLID	Q8IZY5	108 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	RNF169	Q8NCN4	708 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	NLRP7	Q8WX94	980 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF558	Q96NG5	402 aa		18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	18.08	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf42	Q9H799	3197 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TDP2	O95551	362 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MTERF2	Q49AM1	385 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	XKR3	Q5GH77	459 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		18.07	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0U1RQF3	1178 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777		M0R2N6	131 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	EOMES	O95936	686 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PPM1A	P35813	382 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PBX3	P40426	434 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DNM2	P50570	870 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CDC42EP1	Q00587	391 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	KRT17	Q04695	432 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	STK3	Q13188	491 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DRP2	Q13474	957 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	EDA	Q92838	391 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TCF25	Q9BQ70	676 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SPG21	Q9NZD8	308 aa		18.06	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM150B	A6NC51	233 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	STBD1	O95210	358 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	GALNT17	Q6IS24	598 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	MBOAT7	Q96N66	472 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	AIFM3	Q96NN9	605 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	CEP89	Q96ST8	783 aa		18.05	■□□□□ 0.48
DDX11-222	ENST00000542777	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		18.05	■□□□□ 0.48

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