RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542667.5

TM7SF3-211, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 613 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-211ENST00000542667 TTC3P53804 2025 aa16.04■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 VCANP13611 3396 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 DENND3A2RUS2 1198 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 MED24O75448 989 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 OR52Z1P0C646 297 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 ERVK-21P61565 698 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 C4orf19Q8IY42 314 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 NLRP4Q96MN2 994 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.03■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 H3BQV1 296 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 GPR182O15218 404 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 CSPG5O95196 566 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 MCM2P49736 904 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM102BQ5T8I3 360 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 CRIPAKQ8N1N5 446 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TM7SF3-211ENST00000542667 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DGKIO75912 1065 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DNM2P50570 870 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PTGDRQ13258 359 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DSC3Q14574 896 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 EMC2Q15006 297 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 IL17AQ16552 155 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 EPC2Q52LR7 807 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 POTEGQ6S5H5 508 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 MAEAQ7L5Y9 396 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FIBCD1Q8N539 461 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RGS18Q9NS28 235 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 HCSTQ9UBK5 93 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.01■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PP2D1A8MPX8 630 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LINC00271P0C7V0 271 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FGFR1P11362 822 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 SARSP49591 514 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ECM1Q16610 540 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LONRF3Q496Y0 759 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 NPAS4Q8IUM7 802 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 TMEM192Q8IY95 271 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF169Q8NCN4 708 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC7A3Q8WY07 619 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 POLD4Q9HCU8 107 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 C9IYK1 514 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CDC25AP30304 524 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CTNNB1P35222 781 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 CUL4AQ13619 759 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 KIF3AQ9Y496 699 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 USO1O60763 962 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RFC5P40937 340 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 TRAPPC10P48553 1259 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RARRES1P49788 294 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 GPM6BQ13491 265 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FERMT3Q86UX7 667 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ASAP3Q8TDY4 903 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 MTRQ99707 1265 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 GPRC5CQ9NQ84 441 aa15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 LYPLA2O95372 231 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 STAG3L1P0CL83 205 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 FAM189BP81408 668 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 ODR4Q5SWX8 454 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 RNF149Q8NC42 400 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 NEK9Q8TD19 979 aa15.97■□□□□ 0.15
TM7SF3-211ENST00000542667 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms