RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532280.1

PTENP1-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 3,996 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-202ENST00000532280 TDP2O95551 362 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SCNN1DP51172 638 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 ERVK-9P63128 1117 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF844Q08AG5 666 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 NPY5RQ15761 445 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 NEK8Q86SG6 692 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 PNMA3Q9UL41 463 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 TMEM120BA0PK00 339 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SERPING1P05155 500 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SRGNP10124 158 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SERPINB3P29508 390 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 GNA11P29992 359 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SNAP25P60880 206 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 COPS2P61201 443 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 CETN1Q12798 172 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.59■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 FAM196BA6NMK8 535 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 RASA4BC9J798 803 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 RASA4O43374 803 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 TRAPPC3O43617 180 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 LDHCP07864 332 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 TRAPPC10P48553 1259 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 P3H4Q92791 437 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 HIC2Q96JB3 615 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 FAM161BQ96MY7 647 aa15.58■□□□□ 0.09
PTENP1-202ENST00000532280 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 GAS8O95995 478 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NR2F2P24468 414 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CYP2J2P51589 502 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 KIFAP3Q92845 792 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 TLR10Q9BXR5 811 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NWD2Q9ULI1 1742 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CYTH3O43739 400 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ACTN1P12814 892 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CDR2Q01850 454 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 TCP10Q12799 353 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 DNAJC3Q13217 504 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 KAZNQ674X7 775 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 LZTS1Q9Y250 596 aa15.58■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CHMP2AO43633 222 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 GTF2IP78347 998 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NSMFQ6X4W1 530 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ANAPC4Q9UJX5 808 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ATP2A1O14983 1001 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 MAPK13O15264 365 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 GCNT3O95395 438 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CEP95Q96GE4 821 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 PBKQ96KB5 322 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ATRNO75882 1429 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 TNS2Q63HR2 1409 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CDK8P49336 464 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 SCNN1BP51168 640 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 RNF220Q5VTB9 566 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 KCTD1Q719H9 257 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 CNBD1Q8NA66 436 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 USP38Q8NB14 1042 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 SPATA20Q8TB22 786 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 FAXDC2Q96IV6 333 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.57■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 A0A1W2PQC6 194 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 IRF6O14896 467 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 C12orf60Q5U649 245 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 MAML1Q92585 1016 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 NYXQ9GZU5 481 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF287Q9HBT7 754 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 KIF1AQ12756 1690 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 A0A087X0T9 212 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 FAM228BP0C875 321 aa15.56■□□□□ 0.08
PTENP1-202ENST00000532280 EPHB1P54762 984 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms