RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530346.5

GMDS-AS1-206, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 594 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SCLT1Q96NL6 688 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.24■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LPXNO60711 386 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FAM189BP81408 668 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DSC3Q14574 896 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 XKR9Q5GH70 373 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TCP11Q8WWU5 503 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.23■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 COL6A3P12111 3177 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 WDR81Q562E7 1941 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C9IYK1 514 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 H3BQV1 296 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ASAP2O43150 1006 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MGEA5O60502 916 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RB1P06400 928 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TECP42680 631 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CUL4AQ13619 759 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EPC2Q52LR7 807 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM192Q8IY95 271 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ERMNQ8TAM6 284 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CHST12Q9NRB3 414 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.22■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TTC3P53804 2025 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EVPLQ92817 2033 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 POTEMA6NI47 508 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LAD1O00515 517 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZBTB39O15060 712 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MUTP22033 750 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PDIA5Q14554 519 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 STK24Q9Y6E0 443 aa20.21■□□□□ 0.83
GMDS-AS1-206ENST00000530346 A0A087WZ62 844 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 H3BNC9 293 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DGAT1O75907 488 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RPA1P27694 616 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EMC2Q15006 297 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MCTP1Q6DN14 999 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NACC1Q96RE7 527 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DACT1Q9NYF0 836 aa20.2■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 BMPR1AP36894 532 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RARRES1P49788 294 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PTGDRQ13258 359 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PPM1EQ8WY54 764 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 TMEM143Q96AN5 459 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NLRP4Q96MN2 994 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MTRQ99707 1265 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PLVAPQ9BX97 442 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 RAB34Q9BZG1 259 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.19■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 MYO9BQ13459 2157 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HOXA2O43364 376 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LINC00271P0C7V0 271 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PRPHP41219 470 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 POU5F1BQ06416 359 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 NBR1Q14596 966 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 PTPROQ16827 1216 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 FERMT3Q86UX7 667 aa20.18■□□□□ 0.82
GMDS-AS1-206ENST00000530346 KSR1Q8IVT5 923 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms