RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 SCLT1Q96NL6 688 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SH2D3AQ9BRG2 576 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 APOL5Q9BWW9 433 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM150BA6NC51 233 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 FSCN2O14926 492 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 LAG3P18627 525 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TMOD1P28289 359 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 GPC3P51654 580 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 DRP2Q13474 957 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 LRCH2Q5VUJ6 765 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TBCKQ8TEA7 893 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXL18Q96ME1 805 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TEKT3Q9BXF9 490 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ECHDC2Q86YB7 292 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC5A5Q92911 643 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 HIDE1A8MVS5 230 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC730098B7Z3J9 87 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TDP2O95551 362 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 MTERF2Q49AM1 385 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 CLLU1OSQ5K130 101 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXL16Q8N461 479 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 NLRP7Q8WX94 980 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 EDAQ92838 391 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TCF25Q9BQ70 676 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF318Q5VUA4 2279 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMA5P28066 241 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 USP11P51784 963 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 MIER3Q7Z3K6 550 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ABI1Q8IZP0 508 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 HELQQ8TDG4 1101 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 RIT2Q99578 217 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 DARSP14868 501 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 TECP42680 631 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 JAK3P52333 1124 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PLCB3Q01970 1234 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF558Q96NG5 402 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 AIFM3Q96NN9 605 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXA2O43364 376 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMD10O75832 226 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SP100P23497 879 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 STK3Q13188 491 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 LONRF3Q496Y0 759 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC43Q8N309 656 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 DTNBO60941 627 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SFNP31947 248 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 EVCP57679 992 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 RUFY3Q7L099 469 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 TMC7Q7Z402 723 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 MFSD14AQ96MC6 490 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 CDH22Q9UJ99 828 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 LZTS1Q9Y250 596 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 STBD1O95210 358 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 ZXDAP98168 799 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 NHLH1Q02575 133 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 Q4G0T1 1027 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 ANKRD54Q6NXT1 300 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SYCE2Q6PIF2 218 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM67Q6ZTA4 783 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SUSD6Q92537 303 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 S1PR5Q9H228 398 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 SPG21Q9NZD8 308 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 WDFY4Q6ZS81 3184 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A087WZ62 844 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0U1RQF3 1178 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM221A6NGB7 291 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 M0R296 226 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 REC8O95072 547 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 CA8P35219 290 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT17Q04695 432 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNC3Q14003 757 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 BLIDQ8IZY5 108 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 LPPQ93052 612 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP89Q96ST8 783 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRJ-205ENST00000527952 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms