RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TADA3	O75528	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKI	O75912	1065 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	F2	P00734	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	LRG1	P02750	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CHST14	Q8NCH0	376 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	JAM3	Q9BX67	310 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PNMA2	Q9UL42	364 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	VSTM5	A8MXK1	200 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	MAFK	O60675	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	AMY2A	P04746	511 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	APP	P05067	770 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	AMY2B	P19961	511 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TCIRG1	Q13488	830 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FHL2	Q14192	279 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS72	Q15906	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NXN	Q6DKJ4	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	INTU	Q9ULD6	942 aa		5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NEMP1	O14524	444 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GABRD	O14764	452 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GSTA4	O15217	222 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NPHP1	O15259	732 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PDE6A	P16499	860 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ID4	P47928	161 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	DNM2	P50570	870 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ST5	P78524	1137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXE3	Q13461	319 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NXPE1	Q8N323	547 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A13	Q96H72	371 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZEB2	O60315	1214 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO21	O94952	628 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	MYBL2	P10244	700 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GNAT1	P11488	350 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CCND1	P24385	295 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	SCNN1B	P51168	640 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	JAM2	P57087	298 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	IL2	P60568	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR19	Q15760	415 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	CRY1	Q16526	586 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		5.03	□□□□□ -1.6
FAM49B-222	ENST00000522702	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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