RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 VCANP13611 3396 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH11P35749 1972 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 MED24O75448 989 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 TECP42680 631 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 EMC2Q15006 297 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 MCTP1Q6DN14 999 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM143Q96AN5 459 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM2Q99965 735 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A087WZ62 844 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.91■□□□□ 0.94
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SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC10P48553 1259 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 DSC3Q14574 896 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 XKR9Q5GH70 373 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP4Q96MN2 994 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
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SH3BP2-218ENST00000511185 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.948e-8■■■■■ 47.8
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SH3BP2-218ENST00000511185 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 CUL4AQ13619 759 aa20.9■□□□□ 0.94
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SH3BP2-218ENST00000511185 NPAS4Q8IUM7 802 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 IL27Q8NEV9 243 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 NEK9Q8TD19 979 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 HCSTQ9UBK5 93 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF3AQ9Y496 699 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0C4DFX4 3053 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO7AQ13402 2215 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-218ENST00000511185 C9IYK1 514 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR182O15218 404 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 LYPLA2O95372 231 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 EPC2Q52LR7 807 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS18Q9NS28 235 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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SH3BP2-218ENST00000511185 RFC5P40937 340 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 RARRES1P49788 294 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PTGDRQ13258 359 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 IL17AQ16552 155 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FIBCD1Q8N539 461 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 MTRQ99707 1265 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PP2D1A8MPX8 630 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFR1P11362 822 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 CTNNB1P35222 781 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 DNM2P50570 870 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ECM1Q16610 540 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM192Q8IY95 271 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF19AQ9NV58 838 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF410Q86VK4 478 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 PPME1Q9Y570 386 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-218ENST00000511185 ODR4Q5SWX8 454 aa20.85■□□□□ 0.93
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