RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.53□□□□□ -0.249e-17■■■□□ 15.4
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPC3P51654 580 aa13.53□□□□□ -0.24
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.52□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 A0A087WZ62 844 aa13.51□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 NEK9Q8TD19 979 aa13.51□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MED24O75448 989 aa13.5□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DGKIO75912 1065 aa13.5□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STAG3L1P0CL83 205 aa13.5□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTNNB1P35222 781 aa13.5□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPC2Q52LR7 807 aa13.5□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 C9IYK1 514 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSPG5O95196 566 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SYT1P21579 422 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DSC3Q14574 896 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAEAQ7L5Y9 396 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.49□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 TUFT1Q9NNX1 390 aa13.49□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C1orf112Q9NSG2 853 aa13.49□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 USO1O60763 962 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LYPLA2O95372 231 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FGFR1P11362 822 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PDCP20941 246 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDC42EP1Q00587 391 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF410Q86VK4 478 aa13.48□□□□□ -0.25
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.48□□□□□ -0.25
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 ERMNQ8TAM6 284 aa13.48□□□□□ -0.25
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