RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa6.7□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DVL2O14641 736 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 INSRRP14616 1297 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 COMTP21964 271 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 RGS3P49796 1198 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 HHEXQ03014 270 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 FAM89AQ96GI7 184 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.69□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DAPK3O43293 454 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 RAD17O75943 681 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 APOL3O95236 402 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ADCY2Q08462 1091 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DYDC2Q96IM9 177 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 OR14A2Q96R54 314 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 CD248Q9HCU0 757 aa6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SLC26A4O43511 780 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 IL2P60568 153 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DSG1Q02413 1049 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 LRRC32Q14392 662 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 MAN2A1Q16706 1144 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 Q8TCH9 128 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.67□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 RAB11FIP3O75154 756 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 LSP1P33241 339 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PALM2Q8IXS6 379 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 FUKQ8N0W3 1084 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 NXPE1Q8N323 547 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 FERMT2Q96AC1 680 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 WDR92Q96MX6 357 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.66□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 TLDC2A0PJX2 215 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 FOXS1O43638 330 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 LSSP48449 732 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ADAM15Q13444 863 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 GPR158Q5T848 1215 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 RABGGTAQ92696 567 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 ADOQ96SZ5 270 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RBM39-241ENST00000496183 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.65□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PRX2 142 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 CYP27B1O15528 508 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 PDE8AO60658 829 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 TBR1Q16650 682 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 GAGE13Q4V321 117 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 KRT40Q6A162 431 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 EDAQ92838 391 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 USP7Q93009 1102 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 MTFR1LQ9H019 292 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 POFUT1Q9H488 388 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 TBX22Q9Y458 520 aa6.64□□□□□ -1.35
RBM39-241ENST00000496183 FSBPO95073 299 aa6.63□□□□□ -1.35
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