RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CARNS1	A5YM72	827 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF10A	O00220	468 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	VTN	P04004	478 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCN3	P51790	818 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	HSCB	Q8IWL3	235 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	OSMR	Q99650	979 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	GINS2	Q9Y248	185 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	REV3L	O60673	3130 aa		19.37	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	NCOR1	O75376	2440 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH6	O60337	910 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	EOMES	O95936	686 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	CTNNB1	P35222	781 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE3A	Q05086	875 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ST3GAL1	Q11201	340 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	BANK1	Q8NDB2	785 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	NEK9	Q8TD19	979 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	AAAS	Q9NRG9	546 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DACT1	Q9NYF0	836 aa		19.36	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	MGEA5	O60502	916 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LYPLA2	O95372	231 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	RFC5	P40937	340 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	FOSB	P53539	338 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	TFF2	Q03403	129 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	NR5A1	Q13285	461 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO5	Q75V66	913 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA10	Q969M2	543 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX21	Q969T3	373 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		19.35	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0U1RQF3	1178 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	EML1	O00423	815 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	ASAP2	O43150	1006 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DTNB	O60941	627 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
HDAC10-216	ENST00000489424	FSD2	A1L4K1	749 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	BTBD18	B2RXH4	712 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BQV1	296 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SKI	P12755	728 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GJB2	P29033	226 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MTERF2	Q49AM1	385 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		19.33	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	PDC	P20941	246 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	POU5F1B	Q06416	359 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL4A	Q13619	759 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	POTED	Q86YR6	584 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP11	Q8WWU5	503 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP7	Q8WX94	980 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR9	Q96QG7	549 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM50B	Q9Y247	325 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	LZTS1	Q9Y250	596 aa		19.32	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO7A	Q13402	2215 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	NEMF	O60524	1076 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC10	P48553	1259 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNQ1	P51787	676 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	GUCY1B3	Q02153	619 aa		19.31	■□□□□ 0.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CALCRL	Q16602	461 aa		19.31	■□□□□ 0.68

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