RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 RFC5P40937 340 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PAK2Q13177 524 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SPECC1Q5M775 1068 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 HAUS3Q68CZ6 603 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 USP49Q70CQ1 688 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SPRED2Q7Z698 418 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 MYOCDQ8IZQ8 938 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 NLRP7Q8WX94 980 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SLC7A3Q8WY07 619 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 NLRP4Q96MN2 994 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CLIC6Q96NY7 704 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 NACC1Q96RE7 527 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SLC9A7Q96T83 725 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 MTRQ99707 1265 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GPRC5CQ9NQ84 441 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SQORQ9Y6N5 450 aa13.52□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 LCHNA4D1U4 455 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 UPP2O95045 317 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 F13A1P00488 732 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DARSP14868 501 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DNM2P50570 870 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GRB10Q13322 594 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 KRT79Q5XKE5 535 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 USP38Q8NB14 1042 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ASAP3Q8TDY4 903 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 LRRC15Q8TF66 581 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 APBB2Q92870 758 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TIFAQ96CG3 184 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SCLT1Q96NL6 688 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 RAB34Q9BZG1 259 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CSRNP2Q9H175 543 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DGAT1O75907 488 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 AMHP03971 560 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CA3P07451 260 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PADI6Q6TGC4 694 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DEFB123Q8N688 67 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TOP1MTQ969P6 601 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SEMA6BQ9H3T3 888 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 MINDY3Q9H8M7 445 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 IFT122Q9HBG6 1241 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PPME1Q9Y570 386 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa13.5□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TTC3P53804 2025 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ARHGEF35A5YM69 484 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GPR182O15218 404 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TLL1O43897 1013 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 EFCAB14O75071 495 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GJB5O95377 273 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 BMP15O95972 392 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 MUTP22033 750 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GLRA2P23416 452 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ARL2P36404 184 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DSC3Q14574 896 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 SLC39A14Q15043 492 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 HYIQ5T013 277 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CABP7Q86V35 215 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 BSNDQ8WZ55 320 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 EPSTI1Q96J88 318 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ADAM2Q99965 735 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 MSRAQ9UJ68 235 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 EYA4O95677 639 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 BRD1O95696 1058 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CYP11B2P19099 503 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CAPSQ13938 189 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GRIN2CQ14957 1233 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 KARSQ15046 597 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 RAB30Q15771 203 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZNF697Q5TEC3 545 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 GPR153Q6NV75 609 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 ZNF410Q86VK4 478 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-210ENST00000488157 CRIPAKQ8N1N5 446 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms