RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 METTL13Q8N6R0 699 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PBXIP1Q96AQ6 731 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 MFSD14AQ96MC6 490 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 TCF25Q9BQ70 676 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 VN1R3Q9BXE9 311 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 TMEM117Q9H0C3 514 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 KCNH6Q9H252 994 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa12.3□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 C2orf71A6NGG8 1288 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 hCG_1984214I3L0E3 225 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 GPC3P51654 580 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 TEX2Q8IWB9 1127 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 HELQQ8TDG4 1101 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 AAASQ9NRG9 546 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 LZTS1Q9Y250 596 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 C2CD4DB7Z1M9 353 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 OATP04181 439 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 DARSP14868 501 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 LAG3P18627 525 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 RCAN1P53805 252 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PRKCEQ02156 737 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 PTPN21Q16825 1174 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 FBXL6Q8N531 539 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 SLC5A5Q92911 643 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 BRF1Q92994 677 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 LPPQ93052 612 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 POMKQ9H5K3 350 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 WDR81Q562E7 1941 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 MYO10Q9HD67 2058 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-206ENST00000474188 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 M0R2N6 131 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PSMD10O75832 226 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 TDP2O95551 362 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PSAPP07602 524 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 AVPR2P30518 371 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LONRF3Q496Y0 759 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 KSR1Q8IVT5 923 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CKAP2LQ8IYA6 745 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RNF169Q8NCN4 708 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 AIFM3Q96NN9 605 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 DISC1Q9NRI5 854 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 AKT3Q9Y243 479 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 A0A0U1RQF3 1178 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CHMP2AO43633 222 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 BRD1O95696 1058 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ASGR2P07307 311 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EPCAMP16422 314 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 HSPA4P34932 840 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 CCT2P78371 535 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RNF20Q5VTR2 975 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SLC22A17Q8WUG5 538 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MBOAT7Q96N66 472 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ZNF558Q96NG5 402 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PLXNA3P51805 1871 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 VPS13AQ96RL7 3174 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 A0A087WZ62 844 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 WDR64B1ANS9 1081 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EML1O00423 815 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 MAGEB2O15479 319 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 RPS6KB1P23443 525 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 BCAR1P56945 870 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 EVCP57679 992 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-206ENST00000474188 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms