RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 FBXO10Q9UK96 956 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 INVSQ9Y283 1065 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0A6YYJ9 748 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A0G2JNJ9 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 FZD9O00144 591 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA12O60330 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CUTAO60888 179 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KRT1P04264 644 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PPARAQ07869 468 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SPIDRQ14159 915 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PPP2R5AQ15172 486 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR31Q5SQ13 230 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 OGFOD2Q6N063 350 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 GAB3Q8WWW8 586 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NTMQ9P121 344 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 Q9UFV3 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 DPP7Q9UHL4 492 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PRSS50Q9UI38 385 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 COL6A1P12109 1028 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 OSMP13725 252 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF28P17035 718 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 GPR15P49685 360 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC5A3P53794 718 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CDK17Q00537 523 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PKN1Q16512 942 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNK18Q7Z418 384 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CD320Q9NPF0 282 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NRP2O60462 931 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TSPAN15O95858 294 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 AGXTP21549 392 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 POLD1P28340 1107 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 RAP1GAPP47736 663 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 MTNR1BP49286 362 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNQ1P51787 676 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ANTXR2P58335 489 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC00310P59036 64 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CAP1Q01518 475 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ODF1Q14990 250 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNA10Q16322 511 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 MUM1Q2TAK8 710 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 VWA3BQ502W6 1294 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CHPFQ8IZ52 775 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 JADE3Q92613 823 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 DYDC2Q96IM9 177 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CDH19Q9H159 772 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.41□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.4□□□□□ -1.38
PRPF40A-208ENST00000472760 ABLIM3O94929 683 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms