RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	GLG1	Q92896	1179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	C8orf76	Q96K31	380 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	EVPL	Q92817	2033 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	BTBD18	B2RXH4	712 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ENPP3	O14638	875 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	HBP1	O60381	514 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TDP2	O95551	362 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CHRNA1	P02708	482 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ITGB1	P05556	798 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PSAP	P07602	524 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.32	□□□□□ -0.6	3e-7	■□□□□ 8.8
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SP4	Q02446	784 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	NR5A1	Q13285	461 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PPP2R5C	Q13362	524 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CUL4A	Q13619	759 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	LPIN1	Q14693	890 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PLCB4	Q15147	1175 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	FAM167A	Q96KS9	214 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF302	Q9NR11	478 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CLEC1B	Q9P126	229 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245		H0Y858	1186 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	LINC00271	P0C7V0	271 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	INSRR	P14616	1297 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PAK2	Q13177	524 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	MTMR3	Q13615	1198 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	GRIK4	Q16099	956 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	LETM2	Q2VYF4	491 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	TLR9	Q9NR96	1032 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DISC1	Q9NRI5	854 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC37A4	O43826	429 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP4A	P20648	1035 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	NME8	Q8N427	588 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	HAS1	Q92839	578 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-223	ENST00000466245	BACH1	O14867	736 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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