RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 FAM189BP81408 668 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SP4Q02446 784 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NEDD9Q14511 834 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PPP2R5DQ14738 602 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ABI1Q8IZP0 508 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NELL2Q99435 816 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CPVLQ9H3G5 476 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RNF19AQ9NV58 838 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SPTA1P02549 2419 aa14.52□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 HOXA2O43364 376 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ATP5JP18859 108 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 KLRC2P26717 231 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 MARK3P27448 753 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.51□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RPS6KA5O75582 802 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ZNF806P0C7X5 589 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CCND2P30279 289 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 HSD17B4P51659 736 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 KRT76Q01546 638 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FZD5Q13467 585 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FGF14Q92915 247 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ZNF462Q96JM2 2506 aa14.5□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 INPPL1O15357 1258 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 BCAR1P56945 870 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PROSER1Q86XN7 944 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 APPBP2Q92624 585 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NACAP1Q9BZK3 213 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ERAP1Q9NZ08 941 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 GINS2Q9Y248 185 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 F5P12259 2224 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.49□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SNHG28P0DPA3 235 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PFKPQ01813 784 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ADCY1Q08828 1119 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 GNPTABQ3T906 1256 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PARM1Q6UWI2 310 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NAPBQ9H115 298 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.48□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 M0R2C6 588 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 OPLAHO14841 1288 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 AXIN1O15169 862 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 INSRRP14616 1297 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CNR2P34972 360 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 FNTBP49356 437 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 SEMA3FQ13275 785 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 ODR4Q5SWX8 454 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 RNF43Q68DV7 783 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 CHRDQ9H2X0 955 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.47□□□□□ -0.09
NOP56-204ENST00000460258 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms