RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 COPS2P61201 443 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 IL9RQ01113 521 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ASIC2Q16515 512 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SARM1Q6SZW1 724 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PI4K2BQ8TCG2 481 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM60Q9H2L4 133 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.97□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 USP47Q96K76 1375 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 RTN2O75298 545 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ZBED1O96006 694 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 KRT19P08727 400 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 GAL3ST1Q99999 423 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CHID1Q9BWS9 393 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 KLHL31Q9H511 634 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JPF8 293 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CASP14P31944 242 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 ADKP55263 362 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CDK17Q00537 523 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 NFIL3Q16649 462 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL7Q8IXQ5 586 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 INPP5DQ92835 1189 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BRF1Q92994 677 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 GLT8D2Q9H1C3 349 aa5.96□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 TRPC5OSA6NMA1 111 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 H0Y626 953 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 H7C1W4 665 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 YKT6O15498 198 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF9O75901 435 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 GPC3P51654 580 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 USP14P54578 494 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 ADCK1Q86TW2 530 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NPLOC4Q8TAT6 608 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC39Q96DD0 335 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DACH2Q96NX9 599 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.96□□□□□ -1.46
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PTPRC-209ENST00000442510 THAP12O43422 761 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MARK3P27448 753 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SYKP43405 635 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CD97P48960 835 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RIPK1Q13546 671 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SMUG1Q53HV7 270 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM69Q86WT6 500 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NELFBQ8WX92 580 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 AIFM3Q96NN9 605 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NOX5Q96PH1 765 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MNTQ99583 582 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 APOL5Q9BWW9 433 aa5.96□□□□□ -1.46
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