RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436447.5

AFG3L1P-211, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 5

Gene AFG3L1P, Length 3,003 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-211ENST00000436447 SKOR1P84550 965 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 COA1Q9GZY4 146 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.2■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 A0A1W2PRG0 241 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SORBS3O60504 671 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 GCLMP48507 274 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 ACER1Q8TDN7 264 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 KCNJ1P48048 391 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SCFD2Q8WU76 684 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 C18orf8Q96DM3 657 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 WDR18Q9BV38 432 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CD248Q9HCU0 757 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MGARPQ8TDB4 240 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 KRT35Q92764 455 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.19■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PDXKO00764 312 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 GAS7O60861 476 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 NOVP48745 357 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 HYIQ5T013 277 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PBKQ96KB5 322 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CAND2O75155 1236 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FMO5P49326 533 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 C2CD6Q53TS8 623 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 ALG3Q92685 438 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.18■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 F8VZ95 297 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TOM1O60784 492 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 BMP3P12645 472 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FGFR4P22455 802 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 GUCY2CP25092 1073 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 LRRC45Q96CN5 670 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 COG5Q9UP83 839 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 OPLAHO14841 1288 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SOX5P35711 763 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 VPS41P49754 854 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CABS1Q96KC9 395 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC114Q96M63 670 aa20.17■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SLITRK3O94933 977 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 ARP10275 920 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TNFRSF8P28908 595 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 SNX1Q13596 522 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 CSRNP1Q96S65 589 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FMO2Q99518 471 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 EFCC1Q9HA90 598 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 MYL7Q01449 175 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 DR1Q01658 176 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 EPC2Q52LR7 807 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PARVGQ9HBI0 331 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.16■□□□□ 0.82
AFG3L1P-211ENST00000436447 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms