RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1W2PRX2 142 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DVL2O14641 736 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KPNA6O60684 536 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SDSP20132 328 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CD40P25942 277 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ACRV1P26436 265 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NEK4P51957 841 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OCRLQ01968 901 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADAM15Q13444 863 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RIN1Q13671 783 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRM7Q14831 915 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GAGE13Q4V321 117 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EFHBQ8N7U6 833 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RABGGTAQ92696 567 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NINJ1Q92982 152 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DYDC2Q96IM9 177 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C16orf92Q96LL3 132 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FEZ1Q99689 392 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIF1Q9H611 641 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TOMM22Q9NS69 142 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FANCLQ9NW38 375 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CAPN14A8MX76 684 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CYR61O00622 381 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APOL3O95236 402 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 F2P00734 622 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC9A1P19634 815 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ADCY2Q08462 1091 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TCIRG1Q13488 830 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYBPC3Q14896 1274 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NRN1LQ496H8 165 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRT40Q6A162 431 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KIAA1841Q6NSI8 718 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NIM1KQ8IY84 436 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GPR135Q8IZ08 494 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AHI1Q8N157 1196 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 D2HGDHQ8N465 521 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FERMT2Q96AC1 680 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MFSD3Q96ES6 412 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 WDR92Q96MX6 357 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF747Q9BV97 191 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF341Q9BYN7 854 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TLR9Q9NR96 1032 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IFT57Q9NWB7 429 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OXSMQ9NWU1 459 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GOLGA8BA8MQT2 603 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DAPK3O43293 454 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FSHBP01225 129 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 BPIFB4P59827 614 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DSG1Q02413 1049 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PTH1RQ03431 593 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FOXL1Q12952 345 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRHR2Q13324 411 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LRRC32Q14392 662 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MAN2A1Q16706 1144 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MIIPQ5JXC2 388 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CREB3L3Q68CJ9 461 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C11orf74Q86VG3 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ANKRD35Q8N283 1001 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HIST1H2AJQ99878 128 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CSRNP2Q9H175 543 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 POFUT1Q9H488 388 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTG2Q9H4K7 406 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RCAN3Q9UKA8 241 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GIT1Q9Y2X7 761 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NRP1O14786 923 aa3.23□□□□□ -1.89
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTSS1O43312 755 aa3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms