RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 PNMA5Q96PV4 448 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 BHMT2Q9H2M3 363 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 UBA7P41226 1012 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PAK2Q13177 524 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 GRB10Q13322 594 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNK18Q7Z418 384 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 APBB2Q92870 758 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LRCH3Q96II8 777 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PADI3Q9ULW8 664 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 DNM3Q9UQ16 869 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS6KA5O75582 802 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 HYIQ5T013 277 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PADI6Q6TGC4 694 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MAEAQ7L5Y9 396 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF710Q8N1W2 664 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 TCP11Q8WWU5 503 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NLRP4Q96MN2 994 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.54■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087WZ62 844 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 KCNJ6P48051 423 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 DEFB103AP81534 67 aa26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SPTLC2O15270 562 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 USP49Q70CQ1 688 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 EPSTI1Q96J88 318 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NT5C3AQ9H0P0 336 aa26.52■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPRSQ13332 1948 aa26.51■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 EFCAB14O75071 495 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 YEATS4O95619 227 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 EYA4O95677 639 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CDC42EP1Q00587 391 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM119Q4V9L6 283 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM228AQ86W67 206 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ERVK-5Q9HDB9 667 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 GPRC5CQ9NQ84 441 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa26.51■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 KARSQ15046 597 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF410Q86VK4 478 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CALML4Q96GE6 196 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC9A7Q96T83 725 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP11B2P19099 503 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 FGFR4P22455 802 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ARL2P36404 184 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ATL3Q6DD88 541 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ASAP3Q8TDY4 903 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 TMX1Q9H3N1 280 aa26.5■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR182O15218 404 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP6R2O75170 966 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 DDIT3P35638 169 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RABGGTBP53611 331 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 POLD4Q9HCU8 107 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP45Q9UL16 551 aa26.49■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ASAP2O43150 1006 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC26A4O43511 780 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 PBX2P40425 430 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 MYOCDQ8IZQ8 938 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF149Q8NC42 400 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC15Q8TF66 581 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 GBF1Q92538 1859 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 ENPP3O14638 875 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 AMHP03971 560 aa26.47■■□□□ 1.83
UBE2E3-202ENST00000410062 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
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