RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 MCM2P49736 904 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DSC3Q14574 896 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP170P1Q96L14 293 aa23.05■■□□□ 1.28
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UBE2E3-201ENST00000392415 H3BNC9 293 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP4A11Q02928 519 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 TPH2Q8IWU9 490 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 NEK9Q8TD19 979 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP7Q8WX94 980 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF3AQ9Y496 699 aa23.04■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 LYPLA2O95372 231 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.285e-7■■□□□ 11.8
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UBE2E3-201ENST00000392415 FAM189BP81408 668 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF410Q86VK4 478 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 SCLT1Q96NL6 688 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 THEGQ9P2T0 379 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ARID2Q68CP9 1835 aa23.03■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB39O15060 712 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RB1P06400 928 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 BMPR1AP36894 532 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RFC5P40937 340 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF174Q15697 407 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.02■■□□□ 1.28
UBE2E3-201ENST00000392415 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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UBE2E3-201ENST00000392415 A0A087WZ62 844 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 DLL1O00548 723 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 GPM6BQ13491 265 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 XKR9Q5GH70 373 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC38Q5R3I4 469 aa23.01■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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UBE2E3-201ENST00000392415 CTNNB1P35222 781 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 KSR1Q8IVT5 923 aa23■■□□□ 1.27
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UBE2E3-201ENST00000392415 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKEF1Q9NU02 776 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM161AQ9NX61 479 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 OR52Z1P0C646 297 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 FGFR4P22455 802 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 GATMP50440 423 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 PLVAPQ9BX97 442 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO7AQ13402 2215 aa22.99■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC28Q96AY4 2481 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 MUC3AQ02505 3323 aa22.98■■□□□ 1.27
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UBE2E3-201ENST00000392415 TECP42680 631 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 EMC2Q15006 297 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPROQ16827 1216 aa22.98■■□□□ 1.27
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UBE2E3-201ENST00000392415 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM143Q96AN5 459 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRP4Q96MN2 994 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 BACH2Q9BYV9 841 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 CHST12Q9NRB3 414 aa22.98■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.274e-7■■■■□ 26
UBE2E3-201ENST00000392415 GJB2P29033 226 aa22.97■■□□□ 1.27
UBE2E3-201ENST00000392415 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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