RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC16A4O15374 487 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ENC1O14682 589 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GPC3P51654 580 aa22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 DPYSL4O14531 572 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 CSF1RP07333 972 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GUCY2CP25092 1073 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 RASIP1Q5U651 963 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 MB21D1Q8N884 522 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 USP27XA6NNY8 438 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 E9PMD0 336 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZBED1O96006 694 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 IQCB1Q15051 598 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 TFDP2Q14188 446 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 LXNQ9BS40 222 aa22.05■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 POTECB2RU33 542 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC15A2Q16348 729 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 POTEBQ6S5H4 581 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 BAG5Q9UL15 447 aa22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.05■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC31Q6UY01 552 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.04■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 VSTM4Q8IW00 320 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.04■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.04■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 STAT5BP51692 787 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 EPHB4P54760 987 aa22.04■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 STAP1Q9ULZ2 295 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GDAQ9Y2T3 454 aa22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 PSMA2P25787 234 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 GDAP1Q8TB36 358 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.03■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 FLT1P17948 1338 aa22.03■■□□□ 1.12
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NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF543Q08ER8 600 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 NDUFA10O95299 355 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 KRT3P12035 628 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF560Q96MR9 790 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 TIPINQ9BVW5 301 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 SLC25A27O95847 323 aa22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1-201ENST00000360982 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
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