RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SARM1Q6SZW1 724 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.87■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 COL1A2P08123 1366 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPFP49454 3210 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 F2P00734 622 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF18P17022 549 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SOX10P56693 466 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP1A3P13637 1013 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 INSRRP14616 1297 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NCKAP1LP55160 1127 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM143Q96AN5 459 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IFT74Q96LB3 600 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SPC25Q9HBM1 224 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 WBP1LQ9NX94 342 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HTTP42858 3142 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 AP5Z1O43299 807 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 GJA9P57773 515 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 BEX3Q00994 111 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM5Q9C035 493 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM17Q9Y577 477 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R37O75864 691 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY5O95622 1261 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NPTX2P47972 431 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP2R5AQ15172 486 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 TCP11Q8WWU5 503 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 BSNDQ8WZ55 320 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP350Q5VT06 3117 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 KAT6AQ92794 2004 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC169A6NNP5 214 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC16A4O15374 487 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL3P08590 195 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 ARL2P36404 184 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 PPFIA1Q13136 1202 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 STRA6Q9BX79 667 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 THAP9Q9H5L6 903 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-201ENST00000298838 HOXD13P35453 343 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 IGBP1P78318 339 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 RETREG2Q8NC44 543 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PDXKO00764 312 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEB2O15479 319 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KPNA6O60684 536 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 C22orf31O95567 290 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SERPINC1P01008 464 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2BQ00403 316 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCCQ00597 558 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 SPAG1Q07617 926 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNA1Q09470 495 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 IER5Q5VY09 327 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 KAT2BQ92831 832 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YCG3 227 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 PGK1P00558 417 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GLRA2P23416 452 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GRK4P32298 578 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCD1P33897 745 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NAMPTP43490 491 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 NKX3-2P78367 333 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 MFSD10Q14728 455 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GRIK4Q16099 956 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.81■■□□□ 1.24
PACSIN3-201ENST00000298838 GNASQ5JWF2 1037 aa22.81■■□□□ 1.24
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