RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 PGM2Q96G03 612 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CYTH2Q99418 400 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 NAGPAQ9UK23 515 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 LTN1O94822 1766 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 WDR91A4D1P6 747 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 UNC5CO95185 931 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TPBGLP0DKB5 382 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ALADP13716 330 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 FUT2Q10981 343 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 AUHQ13825 339 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 GJB7Q6PEY0 223 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MTHFD1LQ6UB35 978 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 DCAF5Q96JK2 942 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 VCX3BQ9H321 246 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 ERVK-5Q9HDB9 667 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 DCTN4Q9UJW0 460 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM94Q12767 1356 aa12.28□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 CYP27B1O15528 508 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 PEX11AO75192 247 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM266Q2M3C6 531 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 KRT79Q5XKE5 535 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 NMRK1Q9NWW6 199 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM59LQ9UK28 342 aa12.27□□□□□ -0.44
PTPRR-201ENST00000283228 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 THAP12O43422 761 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NPTXRO95502 500 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KCNH2Q12809 1159 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TMED2Q15363 201 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FAM26FQ5R3K3 315 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SNX30Q5VWJ9 437 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ECHDC2Q86YB7 292 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NDNQ99608 321 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C4AP0C0L4 1744 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C4BP0C0L5 1744 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TTC36A6NLP5 189 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LRRC63Q05C16 580 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 UNC13DQ70J99 1090 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GLYCTKQ8IVS8 523 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.27□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN9O14815 690 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NOL4O94818 638 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RPL21P46778 160 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GALCP54803 685 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 OLFML2BQ68BL8 750 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CYP4F22Q6NT55 531 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 C4orf32Q8N8J7 132 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GJA10Q969M2 543 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 OPTNQ96CV9 577 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 GALNT8Q9NY28 637 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAPK13O15264 365 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DDAH1O94760 285 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CYP2D6P10635 497 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP44Q17R89 818 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 CROCCP2Q86T23 111 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KCNMB3Q9NPA1 279 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA6Q9UN73 950 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K7O43318 606 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ATP5DP30049 168 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TMED1Q13445 227 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 SPOCK2Q92563 424 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 FAM196BA6NMK8 535 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TXNDC9O14530 226 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 RIPK2O43353 540 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 TOM1O60784 492 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 NR2F2P24468 414 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 VHLP40337 213 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 IL9RQ01113 521 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 MESDQ14696 234 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 KYNUQ16719 465 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRR-201ENST00000283228 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms