RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 MBD5Q9P267 1494 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RASSF10A6NK89 507 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZBED1O96006 694 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 EPHB1P54762 984 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CAV1Q03135 178 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC17Q96LX7 622 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 KLC2Q9H0B6 622 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZWILCHQ9H900 591 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 BATF3Q9NR55 127 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 NMT2O60551 498 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 FCER1AP12319 257 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CHRNA3P32297 505 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TTI1O43156 1089 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ATICP31939 592 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 A0A1B0GTH6 734 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 K7ERI5 159 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 KRT38O76015 456 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 IRAK1P51617 712 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.339e-7■■□□□ 11.5
SBNO1-201ENST00000267176 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 NDE1Q9NXR1 346 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TC2NQ8N9U0 490 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RNF169Q8NCN4 708 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 E9PCH4 1651 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SYCE1LA8MT33 242 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 OATP04181 439 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PSMA2P25787 234 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PCYT1AP49585 367 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 NR1H3Q13133 447 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 HACE1Q8IYU2 909 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RUBCNQ92622 972 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SNF8Q96H20 258 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PPIP5K2O43314 1243 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ELF1P32519 619 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SEC24CP53992 1094 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CNGA3Q16281 694 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CEP19Q96LK0 163 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ING2Q9H160 280 aa6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 XDHP47989 1333 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 GLI2P10070 1586 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CHN1P15882 459 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 GCLMP48507 274 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 MORF4L2Q15014 288 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 RASSF3Q86WH2 238 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 CPVLQ9H3G5 476 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TET3O43151 1660 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 HAUS5O94927 633 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ARFIP2P53365 341 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 GPS1Q13098 491 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TTC3P53804 2025 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 SLC18A3Q16572 532 aa6.76□□□□□ -1.33
SBNO1-201ENST00000267176 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms