RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 LLGL1Q15334 1064 aa14.83□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.83□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.83□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CTSHP09668 335 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CPB1P15086 417 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CUL4AQ13619 759 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 DBN1Q16643 649 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 PDE1BQ01064 536 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 UNC13DQ70J99 1090 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MB21D1Q8N884 522 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 KCTD6Q8NC69 237 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 VCPKMTQ9H867 229 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 DONSONQ9NYP3 566 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 STK36Q9NRP7 1315 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CDO1Q16878 200 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 KSR1Q8IVT5 923 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.82□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SPDYE6P0CI01 402 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RARBP10826 455 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GPC3P51654 580 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 VEPH1Q14D04 833 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 TKFCQ3LXA3 575 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 POTEFA5A3E0 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SLC25A27O95847 323 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 POTEIP0CG38 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 IFNAR2P48551 515 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 POTEGQ6S5H5 508 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NDST4Q9H3R1 872 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SERPINB6P35237 376 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GUCY2DQ02846 1103 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RESTQ13127 1097 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 EXOC4Q96A65 974 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NYAP2Q9P242 653 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GYS1P13807 737 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MCUQ8NE86 351 aa14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RNF149Q8NC42 400 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 TDP2O95551 362 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CSF1RP07333 972 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 USP11P51784 963 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 TGFB2P61812 414 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 HVCN1Q96D96 273 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 TTC25Q96NG3 672 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 THEGQ9P2T0 379 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GH1P01241 217 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NNMTP40261 264 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GCLMP48507 274 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 POLE2P56282 527 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 ZNF543Q08ER8 600 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 THAP9Q9H5L6 903 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NEMP1O14524 444 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 IKBKBO14920 756 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 GNASQ5JWF2 1037 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 AFG1LQ8WV93 481 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 MOSPD1Q9UJG1 213 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 PTPRUQ92729 1446 aa14.8□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 UPP2O95045 317 aa14.79□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 NR3C2P08235 984 aa14.79□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
USP22-201ENST00000261497 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms