RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 NEMFO60524 1076 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 GUCY1B3Q02153 619 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 CALCRLQ16602 461 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 HSD17B14Q9BPX1 270 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NCOR1O75376 2440 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 SLITRK3O94933 977 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 CTNNB1P35222 781 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 DNM2P50570 870 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NPEPPSP55786 919 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 PTPROQ16827 1216 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 DYDC2Q96IM9 177 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 PLVAPQ9BX97 442 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.91■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 LYPLA2O95372 231 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF410Q86VK4 478 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.9■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 GATMP50440 423 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 TFF2Q03403 129 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NEK9Q8TD19 979 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 NLRP7Q8WX94 980 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 P2RX5Q93086 422 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 CEP170P1Q96L14 293 aa24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
PRADC1-201ENST00000258083 RFC5P40937 340 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CYP4A11Q02928 519 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 AAK1Q2M2I8 961 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 HLA-CQ95604 372 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 MYO7AQ13402 2215 aa24.88■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 A0A087WZ62 844 aa24.87■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ST18O60284 1047 aa24.87■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TXKP42681 527 aa24.87■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.87■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ZBTB39O15060 712 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 GRM6O15303 877 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 BMP1P13497 986 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 COL19A1Q14993 1142 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TPH2Q8IWU9 490 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 SCLT1Q96NL6 688 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 RNF19AQ9NV58 838 aa24.86■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 A0A0U1RQF3 1178 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 FGFR4P22455 802 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 MCM7P33993 719 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TRAPPC10P48553 1259 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 KSR1Q8IVT5 923 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CHST12Q9NRB3 414 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa24.85■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 CAMK1Q14012 370 aa24.84■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 XKR9Q5GH70 373 aa24.84■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 TMX3Q96JJ7 454 aa24.84■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
PRADC1-201ENST00000258083 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms