RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAH12Q6ZR08 3092 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 A0A087X0B3 334 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAGEB2O15479 319 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 USO1O60763 962 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 PFKFB1P16118 471 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 TXLNAP40222 546 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CLCN3P51790 818 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 EMC2Q15006 297 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAF2Q6P1X5 1199 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CAGE1Q8TC20 777 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIAA1524Q8TCG1 905 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 WNT8AQ9H1J5 351 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 BHMT2Q9H2M3 363 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPME1Q9Y570 386 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 ARHGEF35A5YM69 484 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 PITPNM1O00562 1244 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 MAFO75444 373 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 EYA4O95677 639 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTSHP09668 335 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CKBP12277 381 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAG1P15918 1043 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP2C18P33260 490 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 THPOP40225 353 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RFC5P40937 340 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLCB2Q00722 1185 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 DRP2Q13474 957 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 BFSP2Q13515 415 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RESP18Q5W5W9 173 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 EFCAB12Q6NXP0 572 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CEP57L1Q8IYX8 460 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 METTL13Q8N6R0 699 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 RETREG2Q8NC44 543 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC7A3Q8WY07 619 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 SUGCTQ9HAC7 445 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNM3Q9UQ16 869 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.15□□□□□ -0.78
PRAMEF10-201ENST00000235347 CAND2O75155 1236 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 DGAT1O75907 488 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF202O95125 648 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TIMP1P01033 207 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 CCL23P55773 120 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 MGAT3Q09327 533 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM62Q0P6H9 643 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 PADI6Q6TGC4 694 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRC8DQ7L1W4 858 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 RPAINQ86UA6 219 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 PDILTQ8N807 584 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 RAD54LQ92698 747 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 SCLYQ96I15 445 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPP1R16BQ96T49 567 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTRQ99707 1265 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM5Q9C035 493 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 MICAL3Q7RTP6 2002 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAS2O43903 313 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 VTNP04004 478 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 IQCF3P0C7M6 154 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLA2G4BP0C869 781 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 SELPP16109 830 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMOD1P28289 359 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 STAT6P42226 847 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC12A3P55017 1021 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 NLRP12P59046 1061 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 MCM6Q14566 821 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 E2F4Q16254 413 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 NAALADL2Q58DX5 795 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 RSPH3Q86UC2 560 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 EXOC8Q8IYI6 725 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPC24Q8NBT2 197 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TET1Q8NFU7 2136 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 BADQ92934 168 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM143Q96AN5 459 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms