RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 TNFRSF25Q93038 417 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 C8orf76Q96K31 380 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.41■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 EML1O00423 815 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 GPR32O75388 356 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ZP2Q05996 745 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 ST3GAL1Q11201 340 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 HAS1Q92839 578 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.4■■□□□ 1.5
NME4-201ENST00000219479 GRM6O15303 877 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RB1P06400 928 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 BMPR1AP36894 532 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 LTBRP36941 435 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 GUCY1B3Q02153 619 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CALCRLQ16602 461 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 NLRP7Q8WX94 980 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 KIF2CQ99661 725 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ADAM2Q99965 735 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 TMX1Q9H3N1 280 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 FAM50BQ9Y247 325 aa24.39■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 TMEM150BA6NC51 233 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 DCXO43602 365 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 NEMFO60524 1076 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 DGKIO75912 1065 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RABEP1Q15276 862 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 PRKAG3Q9UGI9 489 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 WDFY4Q6ZS81 3184 aa24.38■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ST18O60284 1047 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 SARSP49591 514 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CDC42EP1Q00587 391 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 HYAL1Q12794 435 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 EPHA7Q15375 998 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 FAM228AQ86W67 206 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 LXNQ9BS40 222 aa24.37■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 C19orf67A6NJJ6 358 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 NCK2O43639 380 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ATP2B1P20020 1258 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 GPC3P51654 580 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 SLC24A5Q71RS6 500 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ANO5Q75V66 913 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RGS18Q9NS28 235 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ZNF318Q5VUA4 2279 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 MGEA5O60502 916 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 STBD1O95210 358 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CLUL1Q15846 466 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CEP170P1Q96L14 293 aa24.35■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CSPG5O95196 566 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.494e-18■■■■■ 190.7
NME4-201ENST00000219479 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CYP4A11Q02928 519 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 DYDC2Q96IM9 177 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 RGL1Q9NZL6 768 aa24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 TBX10O75333 385 aa24.33■■□□□ 1.49
NME4-201ENST00000219479 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms