RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pou5f1	P20263	352 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpm3	P21107	285 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptpn22	P29352	802 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cacnb3	P54285	484 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smad4	P97471	551 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smarcc1	P97496	1104 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnasel	Q05921	735 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm525	Q3V3I5	90 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tp53i13	Q5F267	385 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf43	Q5NCP0	784 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d9b	Q5SVR0	1263 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stxbp3	Q60770	592 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hadh	Q61425	314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt14	Q61781	484 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgfr1op	Q66JX5	399 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r26	Q6A025	1163 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr859	Q7TRF5	309 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rsbn1	Q80T69	795 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zswim5	Q80TC6	1188 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slu7	Q8BHJ9	585 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmx4	Q8C0L0	335 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clmn	Q8C5W0	1052 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mill2	Q8HWE5	355 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hyi	Q8R1F5	277 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr130	Q8VFC1	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bnipl	Q99JU7	328 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Actl6b	Q99MR0	426 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9CRW3	126 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc39	Q9D5Y1	937 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex9	Q9D845	387 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taf8	Q9EQH4	308 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem8a	Q9ESN3	769 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vwa7	Q9JHA8	891 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	B4galt4	Q9JJ04	344 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajb7	Q9QYI8	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atp2b2	Q9R0K7	1198 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gys1	Q9Z1E4	738 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nphp3	Q7TNH6	1325 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krtap17-1	A2A5X6	109 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm13101	A2ASJ0	481 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrriq4	A6H6A4	596 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Maff	O54791	156 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casp1	P29452	402 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mmp12	P34960	473 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nat2	P50295	290 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sesn1	P58006	492 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Uhmk1	P97343	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mdga1	Q0PMG2	940 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gsk3a	Q2NL51	490 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zufsp	Q3T9Z9	577 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt26	Q3TRJ4	462 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q3TTL0	348 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ica1l	Q3TY65	431 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrmp	Q60664	539 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gas7	Q60780	421 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk10	Q61831	464 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Irak1	Q62406	710 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbl2	Q64700	1135 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tsen2	Q6P7W5	460 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Asic3	Q6X1Y6	530 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf653	Q6YND2	615 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif1bp	Q6ZPU9	617 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppip5k2	Q6ZQB6	1129 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r14d	Q7TT52	146 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ap4e1	Q80V94	1122 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ofd1	Q80Z25	1017 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q8BGC1	442 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gemin8	Q8BHE1	238 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Acot4	Q8BWN8	421 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arel1	Q8CHG5	823 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dut	Q8VCG1	200 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf112	Q96DY5	654 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ctnnbl1	Q9CWL8	563 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dlgap1	Q9D415	992 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Syap1	Q9D5V6	365 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ybx3	Q9JKB3	361 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znhit2	Q9QY66	399 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Coro1b	Q9WUM3	484 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sumo3	Q9Z172	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Bicdl1	A0JNT9	577 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm12800	B1AUV4	484 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adamts3	E9Q287	1204 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc9a3	G3X939	829 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Orc4	O88708	433 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Myc	P01108	439 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmco2	P0C1V4	183 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mut	P16332	748 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif5a	P33175	1027 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gbx2	P48031	348 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Adamts15	P59384	950 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gas2l3	Q3UWW6	683 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cpa2	Q504N0	417 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lasp1	Q61792	263 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd180	Q62192	661 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Radil	Q69Z89	1099 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mon1a	Q6PDG8	556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgd5	Q80UZ0	1219 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb42	Q811H0	420 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sptlc3	Q8BG54	563 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stac3	Q8BZ71	360 aa		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms