RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14819Q62478 212 aa18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd7Q8CFE5 1130 aa18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lypla2Q9WTL7 231 aa18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GabreA2AMW3 916 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm6121L7MUF1 212 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GcP21614 476 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gga2Q6P5E6 603 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ints2Q80UK8 1198 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam205aA2APU8 1308 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Proca1B0QZF7 307 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MagohP61327 146 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acat1Q8QZT1 424 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cgref1Q8R1U2 281 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MagohbQ9CQL1 146 aa18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtenO08586 403 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trappc3O55013 180 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hoxa11P31311 313 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lmo3Q8BZL8 145 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dennd1aQ8K382 1016 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Psma8Q9CWH6 250 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pramef12Q9D2F1 463 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MycbpQ9EQS3 103 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myoz2Q9JJW5 264 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hebp1Q9R257 190 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lamb2Q61292 1799 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdm11A2AGX3 565 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gimap9G3X987 291 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp8a1P70704 1164 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Skap1Q3UUV5 355 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ndufaf2Q59J78 168 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TbataQ7TSD4 393 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx14Q8BHY8 964 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf771Q8BJ90 317 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc25a38Q91XD8 326 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btaf1E9QAE3 1848 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35g2D3YVE8 412 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm38392E9Q2A2 434 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klc1O88447 541 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tagap1P0CAX8 505 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex11Q14AT2 947 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Large2Q5XPT3 690 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgl1Q60695 768 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dlg4Q62108 724 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Npdc1Q64322 332 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgfr1opQ66JX5 399 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NrcamQ810U4 1256 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rassf10Q8BL43 508 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc28Q8VCE1 385 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grtp1Q9D3N8 359 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q9DAQ4 598 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubiad1Q9DC60 336 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntnap2Q9CPW0 1332 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyth3O08967 399 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Idh1O88844 414 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ItgaeQ60677 1167 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp2r5cQ60996 524 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lamc2Q61092 1191 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cyp26b1Q811W2 512 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35f6Q8VE96 372 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmtm5Q9D6G9 156 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scn3aA2ASI5 1947 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcorl1A2AQH4 1781 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Osbpl7A2A716 963 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm10110D3Z5M2 615 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm2030D3Z7C4 212 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sema6bO54951 886 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ephb4P54761 987 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Msl1Q6PDM1 616 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cnot10Q8BH15 744 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gcfc2Q8BKT3 769 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc15Q8C9M2 810 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp2a1Q8R429 994 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itgb4A2A863 1818 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rad51bO35719 350 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stk10O55098 966 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Etv6P97360 485 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata18Q0P557 537 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf697Q569E7 569 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adad1Q5SUE7 619 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sorbs1Q62417 1290 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cplx4Q80WM3 160 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 WaslQ91YD9 501 aa18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 StrcQ8VIM6 1809 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Got1P05201 413 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ArP19091 899 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncf1Q09014 390 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc33Q3ULW6 985 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms