RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C PRB1P09232 635 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MAS1P10507 462 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SAG1P20840 650 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C GRR1P24814 1151 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SMI1P32566 505 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C LSM12P38828 187 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C EFM3P47163 339 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SMP3Q04174 516 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MSC3Q05812 728 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YOL075CQ08234 1294 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MCT1Q12283 360 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C GLE1Q12315 538 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C HMS1Q12398 434 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DET1Q99288 334 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C COX4P04037 155 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HEM4P06174 275 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CKI1P20485 582 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C GIT1P25346 518 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HMX1P32339 317 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YHR182WP38870 785 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HEM14P40012 539 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ALD5P40047 520 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C IGD1P43598 195 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YDL109CQ12103 647 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PSY3Q12318 242 aa1.46□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C TAL1P15019 335 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C FAR1P21268 830 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CMK2P22517 447 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C DEP1P31385 405 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YEL043WP32618 956 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C UIP5P36137 443 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C GPI18P38211 433 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C BMT2P38278 337 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C WSC4P38739 605 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ATG7P38862 630 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YIL089WP40500 205 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YJR030CP47101 745 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ATP22P50273 684 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CWC22P53333 577 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PRM1P53835 661 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PDR16P53860 351 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C VAC7P53950 1165 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MRPS16Q02608 121 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ENT5Q03769 411 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C FSH2Q05015 223 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ARR1Q06596 294 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C IES4Q08561 116 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PGC1Q08959 321 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PSK1P31374 1356 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C STE7P06784 515 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MXR2P25566 168 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ZUO1P32527 433 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ANP1P32629 500 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MRPS5P33759 307 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SOL2P37262 315 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YPT35P38815 214 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YHR122WP38829 231 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C NAS2P40555 220 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C FYV8P46949 817 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YHC3P47040 408 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C PGU1P47180 361 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C LST7P53237 242 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C VHS1Q03785 461 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C NAT4Q04751 285 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YLR177WQ06251 628 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C APC5Q08683 685 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ATP16Q12165 160 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SFM1Q12314 213 aa1.45□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C TPM1P17536 199 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HXT2P23585 541 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C LDS1P31379 325 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YKR015CP36111 568 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ALP1P38971 573 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RBG1P39729 369 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C SEH1P53011 349 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YPS5P53057 165 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YGR018CP53211 109 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MKC7P53379 596 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C HST1P53685 503 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C IGO1P53897 168 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RRB1Q04225 511 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C GAS2Q06135 555 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C UBA3Q99344 299 aa1.44□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C CBP6P07253 162 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YLL053CP0CD98 152 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C ARF2P19146 181 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C UTR1P21373 530 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C MRPS9P38120 278 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C IST2P38250 946 aa1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
HDA3YPR179C YGL262WP53054 175 aa1.43□□□□□ -2.18
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