RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W STE12P13574 688 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ADK2P26364 225 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MKK1P32490 508 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W WBP1P33767 430 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data9.68□□□□□ -0.86not detected
PRP4YPR178W MET28P40573 187 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W COS10P52924 374 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MNT2P53059 558 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W GPG1P53130 126 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YGR035CP53222 116 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SLI1P53304 468 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W DUS1P53759 423 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W EAR1Q03212 550 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W OST6Q03723 332 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YLR099W-AQ3E798 87 aa9.68□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W QCR7P00128 127 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W REP2P03872 296 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CPA1P07258 411 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MRPL33P20084 86 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W GUT1P32190 709 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W STE5P32917 917 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RFC4P40339 323 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W FMP48P53233 369 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PLM2Q04383 521 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ATG41Q12048 136 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YPR022CQ12139 1133 aa9.67□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ZWF1P11412 505 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MAG1P22134 296 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W KIN3P22209 435 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W EXG1P23776 448 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CDC12P32468 407 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MOT2P34909 587 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W FAU1P40099 211 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W AIM25P47140 327 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SPT20P50875 604 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ROG1P53118 685 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PRM1P53835 661 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SSK1Q07084 712 aa9.66□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W AAC1P04710 309 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W MTF1P14908 341 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W FUS3P16892 353 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W ARF2P19146 181 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W EPT1P22140 391 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PRP28P23394 588 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data9.65□□□□□ -0.86not detected
PRP4YPR178W MAC1P35192 417 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W SRO77P38163 1010 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPS20P38701 121 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W HTD2P38790 280 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W JHD1P40034 492 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W CIN1P40987 1014 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W PYK2P52489 506 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W KAP120Q02932 1032 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RRN11Q04712 507 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W BSP1Q06604 576 aa9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PRP4YPR178W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YGL041W-AP0C5N3 154 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YOL163WP0CF20 169 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W CDC23P16522 626 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W FUN26P31381 517 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PMT2P31382 759 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MRT4P33201 236 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GCS1P35197 352 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SDH8P38345 138 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W COS8P38723 381 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W AIM46P38885 310 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W ALP1P38971 573 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GID8P40208 455 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W LYS12P40495 371 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W LSB6P42951 607 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W NUP57P48837 541 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W HOS2P53096 452 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MTL1P53214 551 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PAU12P53343 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W MEP3P53390 489 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YPQ1Q12010 308 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W YPR015CQ12531 247 aa9.64□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RPS17AP02407 136 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W ARG80P07249 177 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SEC12P11655 471 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RPS17BP14127 136 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W ITR1P30605 584 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W PRE4P30657 266 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SKN1P33336 771 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W TUL1P36096 758 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W RTC2P38279 296 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W GGC1P38988 300 aa9.63□□□□□ -0.87
PRP4YPR178W SSO2P39926 295 aa9.63□□□□□ -0.87
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